Tesis - Microbiología (Sin Restricción)
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Browsing Tesis - Microbiología (Sin Restricción) by Author "*Estrella Vásquez, Sonia Margarita"
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Item Open Access Detección del agente bacteriano causal de la pudrición vascular de tallo y hojas en cultivos de tomate riñón (Solanum lycopersicum) var. Pietro, en las provincias de Pichincha y Cotopaxi(PUCE - Quito, 2021-06-15) Lasluisa Velasco, Diana Karolina; *Estrella Vásquez, Sonia MargaritaEl tomate riñón (Solanum lycopersicum) es una de las hortalizas más importantes a nivel mundial. La producción de tomate es afectada por un sin número de microorganismos y, entre ellos, las bacterias ocupan un lugar significativo al causar enfermedad y producir pérdidas parciales o totales del cultivo. Se han observado esporádicamente síntomas severos similares a marchitamiento y pudrición vascular bacteriana en hojas y tallos en plantaciones en las provincias ecuatorianas de Pichincha y Cotopaxi. Bacterias aisladas a partir de tallos y hojas con sintomatología presentaron colonias circulares, amarillas, translúcidas, convexas, con bordes enteros y no fluorescentes bajo luz ultravioleta, después de ser incubadas a 30 ° C por 24 horas, en agar nutritivo. Los aislamientos mostraron bacterias Gram negativas y Gram positivas, en forma de varilla. Las propiedades fisiológicas, bioquímicas y el sistema semiautomatizado de identificación MicroStation™ de Biolog identificaron a los microorganismos Pantoea agglomerans y Curtobacterium flaccumfaciens. Las secuencias nucleotídicas fueron comparadas con bases de datos referenciales depositadas en GenBank y su porcentaje de identidad fue del 99,5 % con Pantoea agglomerans y 100 % con Curtobacterium flaccumfaciens. Finalmente, mediante postulados de Koch, se corroboró la patogenicidad de las bacterias aisladas como agentes causales de marchitamiento y pudrición vascular en plantas de tomate riñón. Este estudio reporta por primera vez la presencia de los microorganismos C. flaccumfaciens y P. agglomerans como patógenos en cultivos de tomate en Ecuador.Item Open Access Determinación de la resistencia antimicrobiana en cepas de Campylobacter aisladas de pollos de engorde(PUCE - Quito, 2020-06-30) Park Jarrín, Jonathan Alejandro; *Estrella Vásquez, Sonia MargaritaCampylobacter spp. es uno de los principales patógenos transmitidos por los alimentos en todo el mundo, especialmente por contaminación de carne y menudencias de pollo de engorde, principales componentes de la dieta ecuatoriana. Este patógeno está asociado a diarreas infecciosas a nivel mundial. En este estudio, se aisló, identificó y determinó la resistencia de Campylobacter spp. frente a los antibióticos utilizados en la crianza de pollos de engorde provenientes de las ciudades de Loja, Ambato y el cantón San Miguel de Los Bancos. Se analizaron 50 pollos con un total de 200 muestras, a razón de 50 muestras de cada uno de los siguientes tejidos: hígados, mollejas y ciegos, así como contenidos cecales. La bacteria fue aislada en medio selectivo de Butzler e identificada mediante pruebas bioquímicas como catalasa, oxidasa, hipurato de sodio al 1%, entre otras. El género Campylobacter fue confirmado a través de PCR convencional empleando cebadores específicos. 38 (76 %) aislados fueron positivos para Campylobacter spp., de los cuales 26 aislados (68,42 %) fueron C. coli, 7 aislados (18,42 %) C. jejuni, y 5 aislados (13,16 %) fueron C. upsaliensis. A través del método de difusión en disco, se determinó que todas las cepas fueron resistentes a ciprofloxacina, eritromicina y tetraciclina. Además, se demostró sensibilidad en 38 aislados (100 %) a ampicilina y ampicilina-sulbactam y sensibilidad en 23 aislados (60,53 %) a gentamicina.Item Open Access Optimización de un protocolo de extracción de ADN a partir de sangre bovina hemolizada y coagulada para la detección molecular de Anaplasma spp.(PUCE - Quito, 2020-05-04) Landázuri Rafael, Tomás Humberto; *Estrella Vásquez, Sonia MargaritaPara la detección molecular de Anaplasma spp. por PCR se requiere de la extracción de ADN eficiente a partir de sangre completa, lo que a su vez depende de la calidad de la muestra de sangre. La falta de capacitación en toma de muestra o su incorrecta conservación conllevan a la obtención de sangre hemolizada/coagulada. Esto dificulta la detección molecular del patógeno, limitando el alcance de una investigación. Para resolver el problema con este tipo de muestra, se adaptó un protocolo de Chelex-100 con modificaciones sobre el volumen de sangre y la purificación del ADN. Se extrajo ADN de 30 muestras de sangre bovina, hemolizada/coagulada, con el protocolo adaptado y dos kits comerciales de extracción de ADN. Se comparó la positividad por PCR de Anaplasma spp. en las muestras obtenidas, determinándose una buena concordancia de resultados entre los tres protocolos de extracción. Adicionalmente, se empleó el protocolo modificado para obtener ADN a partir de 109 muestras de sangre bovina hemolizada/coagulada. De estas, 64% fueron positivas por PCR para Anaplasma spp. El protocolo de Chelex-100 modificado es eficaz para la extracción de ADN a partir de sangre bovina, hemolizada y coagulada. El ADN obtenido con este protocolo permite la correcta detección molecular de Anaplasma spp. por PCR.