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Item Metadata only Antibacterial and antifungal activity of organic and peptidic extracts of ecuadorian endophytic fungi(2021-05) Narváez Trujillo, Elizabeth Alexandra; Portero Pico, Carolina Elizabeth; Narváez Trujillo, Elizabeth AlexandraAntibacterial and antifungal activities of 32 organic and 14 peptidic extracts obtained from twelve endophytic fungi of the Collection of Endophytes Quito-Catolica were tested against the pathogenic bacteria Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Serratia marcescens, Escherichia coli and Salmonella enteritidis, and against the fungal oomycete Pythium ultimum. It was observed that the extracts of Marasmiellus candidus (CEQCA-O1113), Xylaria laevis (CEQCA-O1399), Fusarium solani (CEQCA-O1393), Diaporthe helianthi (CEQCA-O1394) and Xylaria sp. (CEQCA-O1400) partially or totally inhibited the microorganisms tested. The extracts CEQCA-O1399.P1 and CEQCA-O1113.D1 showed fungistatic and fungicidal effects against P. ultimum, respectively. Six extracts strongly inhibited S. aureus, and E. coli was strongly inhibited by the extract CEQCA-O1113.E2. Based on a bioassay-guided approach, the extracts with strong bioactivity in the antibacterial assays by an agar diffusion method were also tested by a disk diffusion method, and the minimal inhibitory concentrations were determined by a microdilution assay. The most bioactive extract, CEQCA-O1113.D1, was also purified by high performance liquid chromatography. The extract recovered its initial bioactivity against S. aureus in two fractions after the purification. Overall, the results of this study highlight the potential of the fungal endophytes as producers of bioactive compounds.Item Open Access 
Biatriospora (Ascomycota: Pleosporales) is an ecologically diverse genus including facultative marine fungi and endophytes with biotechnological potential(2016-10-01) Portero Pico, Carolina Elizabeth; Narváez Trujillo, Elizabeth Alexandra; Narváez Trujillo, Elizabeth AlexandraBiatriospora (Ascomycota: Pleosporales, Biatriosporaceae) is a genus with unexplored diversity and poorly known ecology. This work expands the Biatriospora taxonomic and ecological concept by describing four new species found as endophytes of woody plants in temperate forests of the Czech Republic and in tropical regions, including Amazonia. Ribosomal DNA sequences, together with protein-coding genes (RPB2, EF1α), growth rates and morphology, were used for species delimitation and description. Ecological data gathered by this and previous studies and the inclusion of sequences deposited in public databases show that Biatriospora contains species that are endophytes of angiosperms in temperate and tropical regions as well as species that live in marine or estuarine environments. These findings show that this genus is more diverse and has more host associations than has been described previously. The possible adaptations enabling the broad ecological range of these fungi are discussed. Due to the importance that Biatriospora species have in bioprospecting natural products, we suggest that the species introduced here warrant further investigation.Item Open Access Characterization of pathogens related to Helianthus annuus cultivated in a production farm and screening of fungal inhibitory extracts(PUCE - Quito, 2016) Benavides Benavides, Berenice Salomé; Portero Pico, Carolina ElizabethApesar de que la producción de Girasol ha aumentado en el Ecuador, los registros de sus enfermedades estan incompletas y por consecuencia el conocimiento acerca de como controlarlas y/o tratarlas está limitando la expansión de este cultivo. Nuestro estudio se enfoca en aislar e identificar algunos de los patógenos de girasol así también de terminar algunos tratamientos potenciales para el control de enfermedades usando extractos de plantas y de hongos endófitos con efectos inhibitorios. Nuestros resultados muestran que cuatro microorganismos aislados de plantas de Girasol enfermas, provenientes de una finca ecuatoriana productora-exportadora, son de hecho patógenos de girasol. Estos resultados son importantes para nuestro país dado que dos de los patógenos aislados (Sclerotinia sclerotiorum, Pseudomonas cichorii) no presentan registro en Ecuador. También se encontró cinco hongos endófitos potenciales que pueden ser usados para controlar de los patógenos de Girasol; ya sea en forma de extracto o como fuente rica en compuestos orgánicos volátiles.Item Metadata only Determinación del potencial de degradación de hidrocarburos por hongos endófitos de la amazonía ecuatorianaNarváez Trujillo, Elizabeth Alexandra; Portero Pico, Carolina ElizabethLa Escuela Superior Politécnica del Litoral, impulsando la sociedad del conocimiento, mediante la Facultad de Ciencias de la Vida encargada de organizar las cuadragésimas XL Jornadas Nacionales de Biología, evento promocionado por la Sociedad Ecuatoriana de Biología y que se constituye como el más importante espacio para la difusión de la investigación e innovación en el área de las Ciencias de la Vida; a realizarse desde el 16 al 18 de noviembre de 2016 en el Campus Prosperina de la ESPOL, en el Auditorio del Centro de Información Bibliotecario y cuenta con la participación de investigadores nacionales e internaciones en las temáticas antes escritas, con el horario de 09h00 hasta las 18h00. Evento trascendental de actualización y fortalecimiento científico que reúne anualmente a científicos, profesionales y estudiantes del área de las ciencias biológicas y ciencias afines de todas las universidades del país en un espacio de integración, diálogo y divulgación de resultados de investigación.Item Metadata only Diversidad de hongos endófitos asociados a polylepis en los andes del EcuadorNarváez Trujillo, Elizabeth Alexandra; Portero Pico, Carolina ElizabethLos bosques de Polylepis, endémicos de los Andes de América del sur, se caracterizan por ser los únicos que forman zonas boscosas a altas elevaciones (hasta 5200 msnm), donde usualmente crecen hierbas y arbustos pequeños. Se caracterizan, además, por su alta diversidad y endemismo, tanto de la flora como de la fauna que sustentan. Adicionalmente, son importantes el contexto de cambio climático, el uso sostenible del suelo alto-andino, la regulación de fuentes hídricas y fijación de carbono. Polylepis no solo es un elemento endémico y ecológicamente importante, sino que además tiene relevancia social y cultural, especialmente para las poblaciones humanas que habitan estas zonas alto-andinas, quienes utilizan estos bosques como fuente de leña, madera o para la agroforestería. Sin embargo, los bosques de Polylepis, se encuentran altamente amenazados, algunos están en riesgo de desaparecer, debido a la destrucción de su hábitat causado especialmente por actividades antropogénicas.Item Open Access Diversidad de hongos endófitos asociados al género Polylepis en el ecosistema del Páramo Andino en los Andes del Norte(PUCE - Quito, 2013) Portero Pico, Carolina ElizabethEl Ecuador ha sido reconocido como un país megadiverso, a pesar que una posee gran diversidad florística en la región Andina, no se ha estudiado acerca de sus microorganismos asociados. Los hongos endófitos son microorganismos simbiontes que colonizan tejidos vegetales asintomáticamente y confieren múltiples beneficios adaptativos a las plantas hospederas, factor que podría ser importante en zonas andinas de páramo donde las condiciones ambientales son adversas. Se tomó a Polylepis incana como un representante del ecosistema páramo y se estudió la diversidad de sus hongos endófitos, así como la de dos de sus especies simpátricas, en dos páramos de la subregiones norte y sur de los Andes ecuatorianos. Adicionalmente se analizó si existía una relación localidad/hospedero en los hongos endófitos de P. incana. Se encontraron 98 especies de hongos endófitos dentro de 240 aislados. A un nivel macro, los páramos ecuatorianos presentaron una composición de hongos endófitos similar a los bosques templados de zonas septentrionales. Al comparar a P. incana en ambas subregiones, la subregión norte presentó una baja diversidad de endófitos posiblemente en función a la altitud, historia evolutiva de los andes y diferencias genéticas del hospedero, además de la presencia de hongos patógenos y generalistas. Adicionalmente, se encontró que la distribución de endófitos en P incana posiblemente se dio en función de la localidad y no del tipo de hospedero. Los resultados enfatizan la necesidad de conservar las comunidades de hongos endófitos en estos ecosistemasItem Metadata only Efecto inhibitorio de extractos orgánicos de hongos endófitos sobre el hongo patógeno batrachochytrium dendrobatidisNarváez Trujillo, Elizabeth Alexandra; Portero Pico, Carolina ElizabethLa Escuela Superior Politécnica del Litoral, impulsando la sociedad del conocimiento, mediante la Facultad de Ciencias de la Vida encargada de organizar las cuadragésimas XL Jornadas Nacionales de Biología, evento promocionado por la Sociedad Ecuatoriana de Biología y que se constituye como el más importante espacio para la difusión de la investigación e innovación en el área de las Ciencias de la Vida; a realizarse desde el 16 al 18 de noviembre de 2016 en el Campus Prosperina de la ESPOL, en el Auditorio del Centro de Información Bibliotecario y cuenta con la participación de investigadores nacionales e internaciones en las temáticas antes escritas, con el horario de 09h00 hasta las 18h00. Evento trascendental de actualización y fortalecimiento científico que reúne anualmente a científicos, profesionales y estudiantes del área de las ciencias biológicas y ciencias afines de todas las universidades del país en un espacio de integración, diálogo y divulgación de resultados de investigación.Item Open Access Evaluación de la actividad antibacteriana de extractos de cianobacterias y microalgas aisladas de páramos ecuatorianos frente a cepas de Staphylococcus aureus y Escherichia coli(PUCE - Quito, 2020) Mena Aguirre, Diego Andrés; Portero Pico, Carolina ElizabethLa resistencia bacteriana es un problema creciente que afecta a la población mundial, siendo Staphylococcus aureus y Escherichia coli, bacterias que presentan frecuentemente resistencias a antibióticos. En el Ecuador estos microorganismos han presentado perfiles inusuales de resistencia, incrementando la mortalidad causada por estos patógenos. Debido a esto, es fundamental la búsqueda de nuevas fuentes de antibióticos, siendo las microalgas provenientes de páramos muy prometedoras, pues se ha visto que climas extremos favorecen la producción de moléculas bioactivas. En el presente estudio se obtuvieron extractos crudos a partir de la microalga Chlorococcum sp. para analizar sus actividades antimicrobianas. Se determinó el efecto de siete factores en la metodología de extracción para optimizar el protocolo y obtener un mayor número de moléculas potencialmente antimicrobianas. De los siete factores examinados solo el procesamiento inicial (masa seca vs. masa húmeda con inactivación) produjo diferencias significativas en el número de moléculas obtenidas. Los extractos no inhibieron el crecimiento de E. coli, mientras que para S. aureus si hubo efecto inhibitorio de 26, 19%. Se evaluaron seis cepas resistentes de S. aureus, de las cuales una, que presenta resistencia intermedia a la clindamicina, fue inhibida por el extracto. Esta investigación es una base para posteriores estudios de las propiedades antimicrobianas de microalgas.Item Metadata only Evaluación de la capacidad inhibitoria de cepas de Trichoderma sp. Ecuatorianos sobre la roya del café (Hemileia vastatrix) en condiciones in vitroNarváez Trujillo, Elizabeth Alexandra; Portero Pico, Carolina ElizabethUna de las enfermedades más importantes del café es la roya producida por Hemileia vastatrix. Este hongo basidiomiceto es un biotrofo obligado que produce esporas que se depositan en las hojas, donde se desarrollan y generan pústulas amarillas. Esta afección produce necrosis y defoliación en la planta, lo cual impide la fotosíntesis y produce la muerte del café. Este trabajo de investigación busca una alternativa biológica para el control de la enfermedad, ya que las medidas fitosanitarias para su control se basan en el desarrollo de cultivares de café resistentes y controles químicos. Sin embargo, estos últimos son compuestos nocivos para la salud y el medio ambiente. Se evaluó el porcentaje de micoparasitismo in vitro de 15 cepas de Trichoderma sp. provenientes de la Colección de Hongos Endófitos Quito Católica (CEQCA). Los tratamientos fueron evaluados con una concentración de 1x106 conidios/ml en suspensión durante 5 días con fotoperiodo de 12 h. Los mayores porcentajes de parasitismo en las uredosporas de H. vastatrix se obtuvieron a las 120 h después de la inoculación, los mayores porcentajes (p = 0.05) se obtuvieron de las cepas 4906 (78 %), 4956 (77 %) y 4911 (63 %). Los resultados obtenidos demuestran el potencial de especies de Trichoderma para el biocontrol de la roya del café.Item Open Access Fusaric acid induces a notochord malformation in zebrafish via copper chelation(2015-04-26) Narváez Trujillo, Elizabeth Alexandra; Portero Pico, Carolina Elizabeth; Strobel, Scott A.Over a thousand extracts were tested for phenotypic effects in developing zebrafish embryos to identify bioactive molecules produced by endophytic fungi. One extract isolated from Fusarium sp., a widely distributed fungal genus found in soil and often associated with plants, induced an undulated notochord in developing zebrafish embryos. The active compound was isolated and identified as fusaric acid. Previous literature has shown this phenotype to be associated with copper chelation from the active site of lysyl oxidase, but the ability of fusaric acid to bind copper ions has not been well described. Isothermal titration calorimetry revealed that fusaric acid is a modest copper chelator with a binding constant of 4.4 9 105 M-1. These results shed light on the toxicity of fusaric acid and the potential teratogenic effects of consuming plants infected with Fusarium sp.Item Open Access Identification of a fungal 1,8-cineole synthase from Hypoxylon sp. with specificity determinants in common with the plant synthases(2015-02-03) Narváez Trujillo, Elizabeth Alexandra; Portero Pico, Carolina Elizabeth; Narváez Trujillo, Elizabeth AlexandraTerpenes are an important and diverse class of secondary metabolites widely produced by fungi. Volatile compound screening of a fungal endophyte collection revealed a number of isolates in the family Xylariaceae, producing a series of terpene molecules including 1,8-cineole. This compound is a commercially important component of eucalyptus oil used in pharmaceutical applications and has been explored as a potential biofuel additive. The genes that produce terpene molecules such as 1,8-cineole have been little explored in fungi, providing an opportunity to explore the biosynthetic origin of these compounds. Through genome sequencing of cineole producing isolate E7406B we were able to identify eleven new terpene synthase genes. Expressing a subset of these genes in E. coli allowed identification of the hyp3 gene, responsible for 1,8-cineole biosynthesis, the first monoterpene synthase discovered in fungi. In a striking example of convergent evolution, mutational analysis of this terpene synthase revealed an active site asparagine critical for water capture and specificity during cineole synthesis, the same mechanism used in an unrelated plant homologue. These studies have provided insight into the evolutionary relationship of fungal terpene synthases to those in plants and bacteria, and further established fungi as a relatively untapped source of this important and diverse class of compounds.Item Metadata only What Do We Know About Fungal Endophyte Diversity in a Mega Diverse Country? An Appeal for Increased Conservation and Research(2021-04-15) Narváez Trujillo, Elizabeth Alexandra; Portero Pico, Carolina Elizabeth; SpringerLinkResearch on endophytic fungi has increased considerably in the last 10 years, and the importance of understanding their biology, ecology, and chemical composition has become a priority. Ecuador’s geography, which ranges from seacoast, to arid mountains, to Amazonian jungle, provides a unique diversity of ecosystems that contain high and unexplored biological diversity. Moreover, the exploration of such unique habitats has been shown to be an effective strategy for the discovery of novel molecules. This chapter intends to provide insights into the diversity and richness of fungal endophytes in a biodiversity hot spot as well as into novel molecules isolated up to date.