Análisis de la comunidad microbiana del Río Usumacinta, México y su relación con variables ambientales
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Date
2023
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Publisher
PUCE - Quito
Abstract
Los sistemas lóticos acuáticos, como los ríos, son entes que transportan agua dulce a lo largo de canales no tan profundos, y cumplen funciones ecosistémicas relevantes y de provecho a las poblaciones humanas, por lo que su estudio y el de sus componentes son de interés. Los microorganismos acuáticos son parte esencial del río, y cumplen funciones biogeoquímicas, y de atenuación de contaminantes y xenobióticos. El objetivo general de este trabajo fue, el caracterizar a la comunidad microbiana de la columna de agua del Río Usumacinta (México) mediante análisis del gen 16S ARNr, para identificar patrones de variación espacial con relación a algunas variables ambientales. Para ello, se extrajo ADN total de muestras de agua colectadas en 5 puntos del río (3 en la cuenca media y 2 en la cuenca baja), se amplificaron fragmentos de la región hipervariable V4 del gen 16S ARNr y se secuenciaron en la plataforma Illumina MiSeq. Tras el análisis bioinformático se observó que las muestras de la cuenca baja mostraron valores de diversidad menores a los de la cuenca media; así mismo, la estructura de la comunidad procariótica fue ligeramente diferente entre ambas cuencas. La comunidad procatiótica estuvo principalmente compuesta por microorganismos pertenecientes a los fila Acidobacterota, Actinobacteriota, Bacteroidota, Crenarchaeota, Cyanobacteria, Desulfobacterota, y Proteobacteria; siendo éste último el más abundante. Las secuencias encontradas fueron afiliadas clases, órdenes y géneros microbianos comúnmente encontrados en sistemas de agua dulce, como Cyanobium, Synechococcus, Rhodobacterales, el clado SAR116, Flavobacterium, Nitrososphaerales, entre otros. Sin embargo, también se encontraron algunos organismos indicadores de fenómenos de contaminación y posiblemente asociados con la extracción y transporte de petróleo, como Acidithiobacillus, Ferritrophicum, Pseudomonas, Acinetobacter, y Sphingomonas, principalmente hacia la cuenca baja donde se han reportado estas actividades. En este trabajo, no se encontraron relaciones significativas entre los parámetros fisicoquímicos como oxígeno disuelto, temperatura, conductividad eléctrica, pH, clorofila “a” y sólidos suspendidos totales, lo cual se ha observado para otros ríos. Sin embargo, estas relaciones podrían encontrarse en futuros estudios considerando un muestreo más amplio y otros parámetros fisicoquímicos, como nutrientes o la longitud media del drenaje dendrítico.
Description
Keywords
Análisis microbiológico, Análisis de agua, Prokaryotae, Cuencas fluviales