Análisis filogenómico de staphylococcus aureus
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Date
2024
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Publisher
PUCE - Quito
Abstract
La resistencia a los antimicrobianos es una amenaza seria para la salud pública, factores como el mal uso de antibióticos, la evolución espontánea y la transmisión de genes resistentes contribuyen significativamente a este problema. Staphylococcus aureus multirresistente, que posee el gen MecA asociado a la resistencia a meticilina, es una preocupación mundial, así mismo, esta bacteria posee otro gen de resistencia conocido como blaZ, que está relacionado con la resistencia a la bencilpenicilina. En Ecuador, las infecciones por S. aureus tienen una alta tasa de mortalidad, especialmente en cuidados intensivos y quirófanos. La filogenómica es esencial para comprender las relaciones evolutivas entre organismos y sus genes, y estudios demuestran que los genes MecA y blaZ han experimentado mutaciones, algunas de las cuales afectan su conservación, también, indica como la evolución de genes de resistencia en S. aureus, tiene patrones de transferencia lateral y vertical de genes. Como parte del planteamiento del problema se destaca la falta de estudios filogenómicos basados en la secuenciación de ADN de cepas de Staphylococcus aureus presentes en pacientes de hospitales o centros médicos en Ecuador. Por tal motivo, se propone un proyecto de investigación que utiliza secuencias de genomas que poseen genes de resistencia como MecA y blaZ, obtenidas de pacientes en Ecuador, para compararlas con secuencias de todo el mundo.En relación con la parte metodológica, se llevó a cabo una preparación exhaustiva de datos que incluyó la búsqueda, selección y comparación de secuencias de genes de resistencia en S. aureus, seguida de alineamientos múltiples de secuencias y la construcción del árbol filogenómico para analizar la evolución de estas cepas en diferentes regiones del mundo.El estudio se enfocó en analizar los genes MecA y blaZ en Staphylococcus aureus, utilizando datos de secuencias de diferentes regiones del mundo. Tras la preparación de datos, se llevaron a cabo búsquedas BLAST y alineamientos múltiples de secuencias con MAFFT y Clustal W. Se construyó un árbol filogenómico, el cual expuso la conservación de los genes y su distribución geográfica, esto permitió discutir la posible transferencia horizontal de genes, la influencia de factores como la presión selectiva y el intercambio genético, y se compararon los resultados con investigaciones previas.Los resultados indicaron una distribución global del gen MecA, sugiriendo transferencias horizontales frecuentes, mientras que el gen blaZ mostró agrupaciones específicas. La conservación de nucleótidos en ambos genes reveló baja variabilidad genética. Además, se identificaron patrones geográficos en la filogenia. En conjunto, estos hallazgos proporcionan una comprensión general de la evolución de los genes de resistencia en S. aureus.
Description
Keywords
Filogenia, Staphylococcus aureus, Bacterias anaerobias, Resistencia a la meticilina