Identificación y divergencia de los dominios proteicos de la familia Hsp (Heat shock protein) en los genomas de Drosophila mesophragmatica, Drosophila cashapamba y Drosophila machachensis
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Date
2020
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Publisher
PUCE - Quito
Abstract
El género Drosophila aparte de ser un conocido modelo de experimentación, también se caracteriza por tener una amplia distribución regional y altitudinal entre sus especies, así, éstas, se pueden distribuir desde el nivel del mar, hasta alrededor de los 5500 m s.n.m. Este amplio rango de distribución y las adaptaciones que sufren estas especies para poder sobrevivir a diferentes condiciones climáticas alrededor del mundo, son las que han convertido a estas especies en un foco de interés para comprender los mecanismos de defensa que permiten la adaptación a diferentes ambientes. En ellas, las proteínas de choque térmico Hsp parecen ser las mejores candidatas; estas, se encuentran en todos los organismos y su función es protegerlos ante eventos de estrés como: cambios de temperatura, déficit de agua, salinidad, radiación, exposición a metales pesados, tóxicos, entre otros factores estresantes. Por esta razón, el objetivo de este estudio es identificar y analizar la divergencia aminoacídica de siete dominios proteicos Hsp 22, Hsp 23, Hsp 26, Hsp 27, Hsp 68, Hsp 70 y Hsp 83 presentes en el genoma de Drosophila mesophragmatica, Drosophila cashapamba y Drosophila machachensis, añadiendo al estudio a siete especies del género Drosophila presentes en el NCBI, indagando su posible adaptación con la altura y región geográfica en la que habitan estas especies. La identificación de las secuencias nucleotídicas de los genes Hsp en D. mesophragmatica, D. cashapamba y D. machachensis se realizó mediante el programa Biolinux y la relación de divergencia se realizó mediante la creación de dendrogramas bajo el método de máxima verosimilitud. No se encontró una relación adaptativa entre la variación aminoacídica de los dominios Hsp y las regiones geográficas en las que se encuentran distribuidas las especies en estudio. Los dendrogramas mostraron una tendencia positiva respecto a las variaciones aminoacídicas de los dominios Hsp 22, Hsp 23, Hsp 27 y Hsp 70 en relación a la distribución altitudinal en la que habita cada especie estudiada, por lo que se sugiere realizar estudios a nivel poblacional y análisis estadísticos para corroborar dicha relación adaptativa.
Description
Keywords
Moscas, Insectos - Ecuador, Genética molecular, Adaptación (Biología), Cambio ambiental global