Búsqueda de deleciones en genomas de SARS-CoV-2 secuenciados en México
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Date
2023
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Publisher
PUCE - Quito
Abstract
El síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2) es el agente causante de COVID-19, que se convirtió en una pandemia mundial en 2020. Los virus de la familia Coronaviridae poseen un genoma de ARN monocatenario en sentido positivo que oscila entre 26 y 32 kilobases (kb) de longitud. El objetivo fue analizar la diversidad de deleciones a lo largo de todo el genoma con las muestras provenientes del consorcio Mexicano de Vigilancia Genómica (CoViGen-Mex) del año 2022. La búsqueda de deleciones en genomas de SARS-CoV-2 secuenciados en México ha arrojado resultados altamente significativos. A través de un algoritmo diseñado para identificar estas deleciones en la secuenciación del genoma del virus. Los resultados obtenidos indican que, de las 900 muestras analizadas, 446 presentaron deleciones en todo el genoma. Además, se identificaron 18 linajes diferentes en estas muestras, siendo los linajes dominantes AY.20 (n = 21 ), AY.26 (n=17), AY.3 (n = 17), y AY.100 (n =14). Este estudio ha permitido encontrar el inicio y final de estas deleciones en las secuencias del genoma, ha demostrado una excelente capacidad para analizar los datos de secuenciación de manera eficiente, identificar deleciones en el genoma del virus y determinar su posición con gran fiabilidad. Lo que puede contribuyen a nuestra comprensión de la variabilidad genética del virus. Además, proporcionan información importante para el estudio de su evolución y dispersión, lo que puede ser de gran utilidad en el desarrollo de estrategias de detección y control de la enfermedad.
Description
Keywords
Covid-19 (Enfermedad), Genomas, SARS - México