Modelamiento y estudio computacional del péptido Picturina - 2 extraída de la secreción cutánea de la rana Boana Picturata
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Date
2023
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Publisher
PUCE - Quito
Abstract
En este trabajo de titulación se analizó y modeló un nuevo peptido antimicrobiano, llamado Picturina — 2, extraído de la piel de la rana Boana Picturata (localizada en la Amazonía Ecuatoriana). Se utilizaron enfoques de diseño de fármacos asistidos por computadora (CADD, siglas en ingles) para alcanzar este objetivo, como modelamiento estructural de proteínas, optimización estructural, y acoplamiento molecular. Está molécula comparte sus propiedades fisicoquímicas con la mayoría de péptidos antimicrobioanos conocidos. La estructura optimizada resultante fue de alta helicidad. Los resultados del acoplamiento molecular mostraron que tienen una alta afinidad con las macromoléculas: N-acetilmuramoil-L-analina amidasa, subunidad B de la ADN girasa, porina F de la membrana externa, proteinasa aspártica secretada; con valores de afinidad de -7,3, -7,8 -8,0 y -6,4 kcal/mol, respectivamente. Está información contribuirá con los próximos pasos de CADD, como la simulación de dinámica molecular.
Description
Keywords
Propiedades fisicoquímicas, Modelos de simulación, Compuestos orgánicos, Péptidos, Anfibios