La rápida urbanización ha intensificado las interacciones humano-fauna silvestre, incrementando el riesgo de transmisión de enfermedades zoonóticas. Este estudio evaluó el estado de salud y la diversidad parasitaria de mamíferos pequeño en el Jardín Botánico Padre Julio Marrero, un fragmento de bosque urbano en Santo Domingo, Ecuador. Se realizó un esfuerzo de captura de 6 480 trampas/noche, capturando 23 individuos pertenecientes a ocho especies de los órdenes Chiroptera (n = 5), Rodentia (n = 11), Lagomorpha (n = 2), y Didelphimorphia (n = 5). Se realizaron evaluaciones físico–clínica, análisis hematológicos y búsqueda de parásitos mediante técnicas microscópicas (frotis directo y flotación) y moleculares en muestras de heces, sangre e hígado. La evaluación clínica reveló parámetros fisiológicos dentro de rangos normales. Los análisis parasitológicos identificaron diversos endoparásitos, incluyendo nematodos y protozoarios, con una prevalencia del 29.4% mediante microscopía, y 35.3% por métodos moleculares. Se detectaron parásitos con potencial zoonótico como Blastocystis spp. y Ancylostoma spp. en roedores, mientras que los didélfidos presentaron tanto parásitos específicos del orden como zoonóticos. Los ectoparásitos incluyeron garrapatas (Ixodes luciae), ácaros (Laelapidae) y pulgas (Rhopallosyllidae) en roedeores y marsupiales. Este estudio demuestra que los mamíferos silvestres urbanos mantienen poblaciones parasitarias diversas mientras conservan un buen estado de salud, destacando la necesidad de vigilancia epidemiológica bajo un enfoque “Una Salud” (One Health).
