Escuela de Ciencias Biológicas
Entérate cómo entregar tus trabajos de titulación
Permanent URI for this community
Browse
Browsing Escuela de Ciencias Biológicas by Subject "ADN"
Now showing 1 - 7 of 7
Results Per Page
Sort Options
Item Open Access 
Análisis de los polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) C2029T en TLR2 y A896G en TLR4 en pacientes con infección con Helicobacter pylori(PUCE - Quito, 2011) Castro Rodríguez, Bernardo David; Pérez Vaca, Oscar DamiánLa bacteria Helicobacter pylori es uno de los organismos patógenos más exitosos que coloniza el estómago del ser humano. La infección con la bacteria está asociada con el desarrollo de una variedad de patologías gástricas que corresponden a cuadros inflamatorios graves que podrían originar cáncer gástrico. El sistema inmune del ser humano es una maquinaria compleja que ha evolucionado en conformidad a los organismos patógenos que el huésped está expuesto. Los Toll-like Receptors (TLRs) son receptores de membrana que se encargan de reconocer PAMPs para la activación de la respuesta inmune; TLR2 y TLR4 son los encargados de reconocer lipopolisacáridos (LPS) de H. pylori. Los polimorfismos de nucleótido simple (SNPs) R677W en TLR2 y D299G en TLR4 provocan cambios estructurales que producen una disminución en la responsividad a los LPS y una disrupción en la estimulación de factores de transcripción que activarán la respuesta inmune respectiva.Item Open Access Caracterización de la dinámica de señalización de PhrA en Bacillus subtilis mediante la utilización de biosensores tipo FRET(PUCE - Quito, 2018) Naranjo Meneses, Pablo Leonardo; Santacruz Flores, Fernando RenéEl género Bacillus comprende algunos microorganismos de importancia clínica e industrial que exhiben la capacidad de producir esporas en condiciones de estrés. El proceso de esporulación demanda un alto gasto energético por lo que es regulado cuidadosamente. En B. subtilis, este proceso está coordinado por la fosfotransferencia KinA-Spo0F-Spo0BSpo0A y el sistema de percepción de cuórum RapA-PhrA. A pesar del amplio conocimiento de ambas rutas, aún existen características no descritas que pueden contribuir al desarrollo de nuevas técnicas de control de la esporulación. El objetivo del presente trabajo fue caracterizar la señalización de PhrA mediante la utilización de biosensores tipo FRET. Para ello, se probó la sensibilidad y especificidad del biosensor mediante experimentos de FRETfotoblanqueo. Se realizaron ensayos de esporulación con B. subtilis y B. amyloliquefaciens, y se monitoreó la producción de PhrA con el biosensor. Más tarde, se elaboró un modelo de respuesta FRET con la finalidad de implementar el biosensor como una herramienta cuantitativa. Por último, se diseñaron varios mutantes de B. subtilis con alteración en el estado de fosforilación de Spo0F. El biosensor demostró sensibilidad a concentraciones nanomolares y alta especificidad a PhrA. La cepa B. subtilis PhrA-deficiente fue incapaz de esporular. La producción de PhrA en la cepa silvestre de B. subtilis cesó posterior a las tres horas de iniciado el proceso de esporulación. Interesantemente, B. amyloliquefaciens mantuvo la síntesis de PhrA después de la tercera hora y exhibió una eficiencia de esporulación del 100 %. La parametrización del modelo permitió cuantificar PhrA en los sobrenadantes de cultivos esporulantes. Todas los mutantes de las quinasas mostraron la misma eficiencia FRET que la cepa silvestre. En base a los resultados se pudo concluir que el biosensor presenta alta sensibilidad, especificidad y puede utilizarse como una herramienta cuantitativa. PhrA resulta esencial para iniciar el proceso de esporulación e influye en la eficiencia de este proceso. La velocidad de internalización de PhrA depende de la concentración de péptidos competidores, no obstante, no existe competición a nivel de receptor de RapA para PhrA. Por último, la interacción PhrA-RapA-Spo0F es independiente del estado de fosforilación de Spo0F.Item Open Access Detección de genes productores de enzimas modificadoras de aminoglucócidos (EMAs) en aislados hospitalarios de Pseudomonas aeruginosa(PUCE - Quito, 2010) Barba Estrella, Pedro Miguel; Alcocer Negrete, Iliana del RocíoLa resistencia bacteriana a antibióticos representa un problema de salud pública de rápido crecimiento, ocasionado, entre otras causas, por el inadecuado uso de antimicrobianos y la rápida dispersión de genes de resistencia. Pseudomonas aeruginosa tiene gran relevancia debido a su alta incidencia en infecciones nosocomiales y al surgimiento de cepas multiresistentes. Los aminoglucósidos representan un grupo de antimicrobianos fundamental en la terapia de infecciones cuyo agente etiológico es Pseudomonas aeruginosa. El objetivo de este estudio fue detectar la presencia / ausencia de genes que codifican enzimas modificadoras de aminoglucósidos (EMAs) en aislados hospitalarios de Pseudomonas aeruginosa.Item Open Access Diversidad de hongos endófitos en la Cueva de “Los Tayos” (Morona Santiago; Ecuador)(PUCE - Quito, 2020) Silva Quitiguiña, Paula Camila; Ordoñez Maldonado, María EugeniaLa Cueva de Los Tayos es un conjunto de cavidades subterráneas de geotipo kárstico ubicada en las estribaciones de la Cordillera del Cóndor al sureste de Ecuador. Este estudio brinda el primer registro de diversidad de hongos endófitos asociados a la vegetación presente en la Cueva de Los Tayos. En total, se aislaron 69 hongos endófitos a partir de fragmentos de hojas y tallos de las siete especies vegetales creciendo dentro de la cueva, que fueron clasificados en 42 morfotipos según sus características macroscópicas. Mediante el uso de los cebadores universales en eucariotas ITS1/ITS4 se obtuvieron las secuencias de ADN de 48 hongos endófitos, los cuales pertenecen únicamente el filum Ascomycota. Se encontraron patrones de diversidad relacionados a su frecuencia de colonización según el tejido vegetal, especie de planta, estado de etiolación y zona de la cueva. Se registró una predominancia de los géneros Xylaria y Mycoleptodiscus, con una mayor riqueza en tallos que en hojas. Además, las plantas con mayor riqueza de hongos endófitos fueron las que crecen en zonas luminosas, identificándose 11 géneros: Xylaria, Mycoleptodiscus, Diaporthe, Colletotrichum, Dactylonectria, Fusarium, Mucor, Neonectria, Phomopsis, Sporothrix y Talaromyces. La especie vegetal etiolada de la zona del Domo muestra un género propio, Hypoxylon. El muestreo y la caracterización de endófitos fúngicos es un desafío emergente entorno a la necesaria comprensión de su papel ecológico y promete dilucidar nuevas especies y compuestos bioquímicos útiles. Con esta nueva información de hongos endófitos de una cueva kárstica de un bosque tropical amazónico, se pone hincapié en la necesidad de aumentar exploraciones de organismos microscópicos y brinda información biológica útil para la conservación de este ecosistema.Item Open Access Optimización de un protocolo de extracción de ADN a partir de sangre bovina hemolizada y coagulada para la detección molecular de Anaplasma spp.(PUCE - Quito, 2020) Landázuri Rafael, Tomás Humberto; Estrella Vásquez, Sonia MargaritaPara la detección molecular de Anaplasma spp. por PCR se requiere de la extracción de ADN eficiente a partir de sangre completa, lo que a su vez depende de la calidad de la muestra de sangre. La falta de capacitación en toma de muestra o su incorrecta conservación conllevan a la obtención de sangre hemolizada/coagulada. Esto dificulta la detección molecular del patógeno, limitando el alcance de una investigación. Para resolver el problema con este tipo de muestra, se adaptó un protocolo de Chelex-100 con modificaciones sobre el volumen de sangre y la purificación del ADN. Se extrajo ADN de 30 muestras de sangre bovina, hemolizada/coagulada, con el protocolo adaptado y dos kits comerciales de extracción de ADN. Se comparó la positividad por PCR de Anaplasma spp. en las muestras obtenidas, determinándose una buena concordancia de resultados entre los tres protocolos de extracción. Adicionalmente, se empleó el protocolo modificado para obtener ADN a partir de 109 muestras de sangre bovina hemolizada/coagulada. De estas, 64% fueron positivas por PCR para Anaplasma spp. El protocolo de Chelex-100 modificado es eficaz para la extracción de ADN a partir de sangre bovina, hemolizada y coagulada. El ADN obtenido con este protocolo permite la correcta detección molecular de Anaplasma spp. por PCR.Item Open Access Sistemática del complejo de especies Hypsiboas fasciatus (Günther, 1858) e Hypsiboas calcaratus (Troschel, 1848) (Anura: Hylidae)(PUCE - Quito, 2010) Caminer Rodríguez, Marcel Adrián; Ron Melo, Santiago RafaelHypsiboas calcaratus e H. fasciatus son dos especies de ranas arborícolas con amplia distribución en la cuenca amazónica. Información genética de poblaciones de Guyana y Perú ha sugerido que se trata de un complejo de especies. En el presente trabajo se analiza el número de linajes a nivel de especies de las poblaciones de H. calcaratus e H. fasciatus en la amazonía ecuatoriana. Para ello, se examinaron conjuntamente la variación genética (secuencias de ADN mitocondrial y nuclear), morfológica y de cantos para establecer si existe correspondencia entre los diferentes grupos de datos. Los análisis genéticos generaron seis clados con buen soporte.Item Open Access Variación histórica y espacial de la estrutura genética de dos poblaciones de Ceroxylon echinulatum Galeano (palma de ramos, Arecaceae) bajo diferentes niveles de impacto humano(PUCE - Quito, 2010) Espinoza Ulloa, Sebastián Antonio; Montúfar Galárraga, Rommel JoséloLos bosques de las estribaciones noroccidentales andinas del Ecuador están amenazados por las actividades humanas, alterando de esta manera la ecología y consecuentemente la estructura genética y dinámica poblacional de muchas especies. El estado y la conservación de un ecosistema depende de la condición poblacional de las especies claves (especies que tienen múltiples interacciones ecológicas). Ceroxylon echinulatum (palma de ramos o palma de cera) es un componente importante dentro de los bosques andinos (>1000 metros sobre el nivel del mar).