Browsing by Author "Zabala Parreño, Andrés Esteban"
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Análisis molecular de eSCHERICHIA COLI uropatógena en cepas almacenadas de laboratorios clínicos privados tipo lac-2 en dos ciudades del ecuador en el periodo 2023-2024(PUCE - Quito, 2026) Bejarano Pinto, Karla Elizabeth; Díaz Morales, Victoria Alejandra; Zabala Parreño, Andrés EstebanIntroducción: Escherichia coli uropatógena (UPEC) es el principal agente etiológico implicado en infecciones del tracto urinario tanto en el ámbito comunitario como hospitalario. Su capacidad para adquirir y diseminar genes de resistencia antimicrobiana ha favorecido el incremento de cepas de tipo multirresistentes. Su circulación fuera del entorno hospitalario representa un desafío creciente para el tratamiento empírico y seguridad del paciente. Materiales y métodos: Se realizó un estudio de tipo observacional, descriptivo y transversal, se recolectaron 200 cepas de Escherichia coli uropatógena almacenadas de laboratorios clínicos privados de tipo LAC-2 de las ciudades de Quito e Ibarra durante el período 2023-2024. El perfil de susceptibilidad se determinó por el método de difusión en disco: Kirby-Bauer, siguiendo criterios del CLSI M100:2025. La caracterización genotípica se efectuó por extracción de ADN y PCR convencional para la detección de genes de resistencia a betalactámicos, fluoroquinolonas, fosfónicos, nitrofuranos y carbapenémicos. Resultados: El análisis genotípico evidenció una alta prevalencia de genes de β-lactamasas, principalmente blaTEM, lo que explica la resistencia a penicilinas y combinaciones con inhibidores. Los genes asociados a resistencia a fluoroquinolonas y fosfomicina se detectaron en menor proporción. Se analizó la presencia de los genes de carbapenemasas, se mostraron fenotípicamente sensibles pero con resistencias para IMP y OXA, con estos resultados se evidenció la circulación silenciosa de ciertos mecanismos de resistencia. La detección de genes en cepas fenotípicamente sensibles sugiere una expresión variable y la participación de mecanismos adicionales. Conclusiones y recomendaciones: Se logró caracterizar molecularmente los genes de resistencia, se observó una elevada frecuencia de genes de β-lactamasas, lo que evidencia un riesgo de resistencias clínicas elevadas en pacientes ambulatorios. Se recomienda la utilidad del análisis genotípico en la vigilancia comunitaria, promover el uso racional de los antibióticos cumpliendo el esquema establecido por el profesional y continuar con estudios que ayuden a la caracterización molecular.Item Open Access Candidemias nosocomiales: epidemiología y susceptibilidad antifúngica en América Latina. Revisión bibliográfica narrativa(PUCE - Quito, 2022) Pazmiño Romero, Carla Monserrath; Zabala Parreño, Andrés EstebanLa candidemia es una enfermedad fúngica invasiva causada por Candida spp. La fuente de infección por Candida spp. puede ser endógena es decir por la colonización mucocutánea o por la flora gastrointestinal y exógena, por el contacto con superficies contaminadas especialmente en espacios dedicados al área de la salud como hospitales o centros médicos, de esta manera, los grupos etarios comúnmente afectados son neonatos y adultos mayores debido al estado de su sistema inmune y de las comorbilidades que poseen. Metodología: Se realizó una revisión bibliográfica narrativa incluyendo casos clínicos y artículos originales reportados en América Latina acerca de resistencias y epidemiología de las candidemias. El período de revisión comprende las publicaciones desde enero 2010 a octubre 2021. La información recolectada se basó en el país de reporte de caso, agente causal de la candidemia, resistencia antimicótica y tasa de mortalidad. La depuración de la información se realizó de acuerdo con el flujo PRISMA propuesto por Moher (2009) con la finalidad de excluir los artículos innecesarios para la presente investigación. Resultados: Se encontraron 202 reportes de casos que cumplían con los criterios de inclusión. El patógeno con más reportes fue Candida albicans con un total de 72 reportes clínicos seguido de Candida parapsilosis y Candida tropicalis con 45 y 39 casos respectivamente. Brasil mostró el mayor reporte de casos con un total de 48 casos clínicos. Entre la epidemiología se evidenció prevalencia de candidemias en pacientes de primera infancia (35,1%) y en adultos mayores (42,6%) además del predominio de la enfermedad en pacientes del sexo masculino. Respecto a la morbilidad, el área hospitalaria de internamiento del paciente (20%) y el tiempo de estancia hospitalaria (33.5%) mostraron mayor porcentaje. La resistencia a fármacos demostró la prevalencia en fluconazol. La tasa de mortalidad en candidemias fue variable siendo los adultos mayores los que poseen mayor porcentaje de mortalidad registrando 47 casos de muerte de un total de 86 casos de candidemias. Conclusiones: Se observó prevalencia de Candida albicans en todos los países de América Latina. Las circunstancias para el desarrollo de candidemias varían en los distintos casos reportados, sin embargo, las comorbilidades, procedimientos invasivos y tiempo de estancia hospitalaria son los principales factores para que la enfermedad avance con rapidez.Item Open Access Caracterización del perfil de suceptibilidad a Voriconazol y Anidulafungina en cepas de candida almacenadas en el laboratorio de micología clínica de la Carrera de Bioquímica Clínica-PUCE Quito(PUCE - Quito, 2020) Flores Bravo, Ruth María; Vaca Riofrío, María Fernanda; Zabala Parreño, Andrés EstebanLa candidiasis es una infección causada por cualquier especie de candida. Durante la última década, se ha presentado un incremento de los niveles de resistencia a los antifúngicos comunes, siendo las especies de Candida no albicans las que muestran mayores porcentajes de resistencia. Es por eso que el uso de técnicas para el estudio de la susceptibilidad antifúngica in vitro ha tomado un papel importante para la elección de antimicóticos clínicamente efectivos durante el tratamiento. La técnica de microdilución en caldo se considera el gold standard y existen guías para su estandarización, como la CLSI M27-A3. Este estudio se centra en la implementación de la técnica descrita en la guía del CLSI con cepas del laboratorio de docencia de Micología Clínica de la Pontificia Universidad Católica del Ecuador. Materiales y métodos: El experimento se dividió en dos etapas. La primera etapa consistió en la implementación de la técnica para voriconazol y anidulafungina, donde se aplicó la técnica descrita en un procedimiento operativo estándar aplicado a las cepas C. krusei ATCC 6258 y C. parapsilosis ATCC 22019, luego se analizó los resultados para obtener datos estadísticos que demuestren su estabilidad y desempeño. La segunda etapa incorporó el estudio de 40 cepas de Candida spp. conservadas en el laboratorio para la obtención de sus perfiles de susceptibilidad para los antifúngicos usados en la implementación. Resultados: Dentro del análisis estadístico para la validación de la técnica, se logró un 100% de los resultados de CMI de las cepas control dentro del intervalo de referencia de CMI de los antifúngicos utilizados. La cepa C. parapsilosis ATCC 22019 tiene una mayor precisión, mientras que C. krusei ATCC 6258 alcanzó una mayor exactitud en los dos antifúngicos, en tanto a la variabilidad intraoperador los datos mostraron una correlación directa perfecta para los mismos antifúngicos por distintas operadoras. La población de estudio para determinar el perfil de susceptibilidad fue de 40 cepas. Las cepas sensibles a voriconazol fueron: C. albicans (17/20), C. tropicalis (10/12) y C. glabrata (1/5), siendo C. guillermondii la única cepa 100% resistente para este antifúngico. Para anidulafungina se determinaron como 100% sensibles C. tropicalis y C. glabrata, C. albicas (18/20) y C. guillermondii (2/3). El POE se encuentra expuesto en su totalidad en el anexo 2. Conclusiones y recomendaciones: El proceso de validación estadística demostró que la microdilución en caldo para determinar perfiles de susceptibilidad de especies de candida frente a voriconazol y anidulafungina es una técnica con buen desempeño analítico. La caracterización de la susceptibilidad de las cepas de Candida spp. almacenadas en el laboratorio de docencia de Micología Clínica de la PUCE incluidas en este estudio demostró que C. guillermondii ha desarrollado una resistencia intrínseca a voriconazol, mientras que C. tropicalis y C. glabrata mantienen una sensibilidad del 100% frente a anidulafungina por lo que es recomendable delimitar los niveles de sensibilidad y resistencia de la totalidad de cepas viables almacenadas. Como se detalla en el POE es importante prevenir contaminaciones del caldo de cultivo a utilizar por lo que es recomendable esterilizarlo por filtración.Item Open Access Caracterización del perfil de susceptibilidad de Pseudomonas spp. en cepas procedentes del cepario de la carrera de Laboratorio Clínico- PUCE(PUCE - Quito, 2023) Gómez Inca, Ambar Nicole; Véliz García, Angie Mariela; Zabala Parreño, Andrés EstebanINTRODUCCIÓN: Pseudomonas spp. son bacilos Gram negativos no fermentadores y aerobios facultativos los cuales provocan infecciones en las zonas más representativas como tejidos y órganos, se pueden dar por la capacidad de adaptación, diseminación y adquisición de nuevos mecanismos de resistencia siendo considerada un fenómeno de impacto ascendente relacionada con la seguridad del paciente a nivel intrahospitalario. El perfil de resistencia antibiótica para Pseudomonas spp. se clasifica como: multirresistentes (MDR), cepas extremadamente resistentes (XDR) y pan-resistentes (PDR). Por este motivo, afecta la formación de enzimas o mutaciones que inactivan antibióticos tales como β-lactámicos y carbapenémicos. La problemática se basa en los genes de resistencia que se desencadena por el uso frecuente y erróneo de antibióticos e incorrecta identificación de género-especie. MATERIALES Y MÉTODOS: El proyecto se dividió en 4 fases. La primera, selección de cepas de Pseudomonas spp., posterior coloración Gram, pruebas bioquímicas y enzimáticas que identificaron cada una de las cepas. La segunda, determinación del perfil fenotípico por difusión en disco, consecuente a ello se obtuvo una lectura interpretativa distribuida por la clasificación de Ambler. La tercera, identificación genotípica de las cepas establecido por extracción del ADN y amplificación de los genes de resistencia. Finalmente, la cuarta fase controles de calidad en cada procedimiento realizado. RESULTADOS: El 73,4% (47/64) de las cepas identificadas como Pseudomonas spp. se asoció con la clasificación genotípica el 38,30% de clase A, 10,64% clase B, 2,13% clase C y 6,38 % clase D. Seguidamente se amplificaron las cadenas de ADN y genes de resistencia con la Master Mix - PCR de punto final para visualizar el producto examinado mediante una corrida electroforética. Se obtuvo que el gen más prevalente es blaGES con un 38,30% (18/47) y la cepa predominante es P. aeruginosa con una prueba estadística con valor p de 0,013. CONCLUSIONES Y RECOMENDACIONES: La lectura interpretativa del antibiograma deduce mecanismos de resistencia y puntos de corte de cada antibiótico. Se observó prevalencia del gen blaGES/Clase A en la mayoría de las cepas que generarían resistencia a otras familias de fármacos, las carbapenemasas desarrollan resistencia por perdidas de porinas, β-lactamasas y biofilms. Se sugiere la correcta identificación bacteriana y el uso apropiado del CLSI M:100, 2023, ya que no todos los mecanismos de resistencia son definitivos y se recomienda el uso de pruebas complementarias.Item Open Access Caracterización molecular de la cápsula de neumococo en cepas almacenadas en la carrera de laboratorio clínico en la PUCE, 2023 – 2025(PUCE - Quito, 2026) Castro Mena, Kattya Romina; Hidalgo Lanchimba, Allison Dayana; Zabala Parreño, Andrés EstebanIntroducción: Streptococcus pneumoniae es un patógeno clínicamente importante por causar infecciones invasivas y no invasivas, sobre todo en niños y adultos mayores. Su principal factor de virulencia es la cápsula polisacárida, cuya variabilidad determina más de 100 serotipos, la caracterización molecular de los genes capsulares permite identificar con mayor precisión los serotipos circulantes y su relación con la resistencia antimicrobiana. Este estudio tuvo como objetivo caracterizar molecularmente la cápsula de cepas almacenadas en la carrera de Laboratorio Clínico de la PUCE (2023-2025), y correlacionar los serotipos con variables demográficas y perfiles de sensibilidad antimicrobiana. Materiales y métodos: Esta investigación corresponde a un estudio descriptivo, observacional y transversal en 62 cepas de Streptococcus pneumoniae previamente aisladas. Se analizaron perfiles fenotípicos y genotípicos mediante PCR de punto final para los genes ply, cpsA y cpsB, confirmando la identidad y la presencia del operón capsular. La serotipificación se efectuó mediante PCR específica de genes capsulares de relevancia clínica. La sensibilidad antimicrobiana se obtuvo de antibiogramas según CLSI y se correlacionó con variables demográficas y serotipos mediante la prueba de chi cuadrado (p < 0,05). Resultados: La caracterización molecular confirmó la identidad de 56 de las 62 cepas y permitió identificar diversos serotipos circulantes durante el periodo de estudio. Algunos serotipos fueron más frecuentes en determinados grupos etarios. Se evidenció una asociación significativa entre ciertos serotipos y la resistencia a eritromicina, clindamicina y trimetoprima sulfametoxazol, así como altos niveles de resistencia a oxacilina como marcador de penicilina, demostrando que la resistencia antimicrobiana varía según el serotipo y sugiere la circulación de linajes capsulares con perfiles de resistencia específicos. Conclusiones y recomendaciones: La caracterización molecular de la cápsula permitió identificar los serotipos presentes y evidenciar patrones epidemiológicos relevantes para la vigilancia de Streptococcus pneumoniae. La asociación entre serotipos y resistencia antimicrobiana resalta la importancia de integrar técnicas moleculares en el diagnóstico y monitoreo. Se recomienda mantener una vigilancia continua, actualizar los paneles de PCR según serotipos emergentes y utilizar estos resultados para orientar tratamientos empíricos y apoyar la evaluación de políticas de vacunación.Item Open Access Caracterización molecular de las especies de Candida almacenadas en el laboratorio de micología clínica de la Carrera de Bioquímica Clínica, Facultad de Medicina de la Pontificia Universidad Católica del Ecuador en la ciudad de Quito correspondientes al período de enero 2000 a agosto 2007(PUCE - Quito, 2020) Yánez Domínguez, Degsy Dayana; Zabala Parreño, Andrés EstebanIntroducción: Actualmente las técnicas fenotípicas en el laboratorio de Micología Clínica presentan muchas dificultades, ya que no se logra la identificación de género y especie haciendo necesario el desarrollo de técnicas moleculares (PCR) y sus variantes. Esta técnica presenta varias ventajas por su rapidez en el análisis, menor riesgo de contaminación y facilidad al manejo de la muestra. El objeto de este estudio fue comparar las prueba molecular de las reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y métodos convencionales para identificar las diferentes especies de Candida, incluyendo el sistema API 20C AUX, la técnica de Dalmau y la morfogénesis en agar harina de maíz. Materiales y métodos: El presente estudio fue de tipo observacional descriptivo para la identificación de género y especie de 170 cepas de Candida almacenadas en el cepario del laboratorio de Micología de la Carrera de Bioquímica Clínica-PUCE, utilizando métodos de identificación fenotípica (prueba Dalmau, tubo germinal y Api) y genotípica, se aplicó una PCR con ayuda de cebadores específicos para las siguientes especies: C. albicans, C. glabrata, C. guilliermondii, C. krusei, C. tropicalis, C. parapsilosis y C. auris. A las cepas que presentaron discrepancias en la identificación genotípica y no se encontraron entre los cebadores a usar se realizó correlación entre la técnica Dalmau y el API 20C AUX. Resultados: Entre las 170 cepas de candidas, la más frecuente en todo el estudio fue C. albicans 58% (99/170), seguido de C. tropicalis 25% (42/170), C. glabrata 6% (11/170), C. guilliermondii 5% (9/170), C. parapsilosis 2% (3/170) y C. krusei 1% (1/170). C. auris no se encontró en él estudio. Se reconocieron cepas identificadas como C. famata 1% (2/170) y C. lusitaniae 1% (2/170) que se identificaron por el sistema API 20C AUX. Al comparar los resultados obtenidos por el método fenotípico y el genotípico se obtuvo un índice kappa de 0.77 entre la técnica Dalmau y la PCR, con una coincidencia del 100% (99/99) para C. albicans, 67% (28/42) para C. tropicalis, 64% (7/11) para C. glabrata, 56% (5/9) para C. guilliermondii. En las cepas de C. krusei y C. parapsilosis solo se logró identificar mediante AHM y no se logró amplificar mediante PCR. Conclusiones y recomendaciones: El agar harina de maíz + Tween 80 resulta útil para la identificación de las especies de Candida promoviendo la morfogénesis, principalmente en C. albicans y C. tropicalis. De acuerdo al índice kappa se obtuvo una buena concordancia entre los métodos utilizados en la investigación sin embargo no es recomendable la sustitución del método Dalmau por la PCR como identificación de especie, ya que se requeriría la confirmación mediante secuenciación. Se sugiere complementar este estudio comparando otros métodos como CHROMagar, snPCR, Vitek, D1-D2 rDNA, ITS secuenciación, y estudiar a fondo en cada una de las especies los factores de virulencia y los mecanismos de resistencia a los antimicóticos.Item Open Access Control de calidad en la lectura interpretativa del antibiograma basada en los criterios de organismos internacionales para la determinación de mecanismos de resistencia antimicrobiana(PUCE - Quito, 2022) Granja Aguirre, Emilia Alejandra; Mejía Ron, Romina Gabriela; Zabala Parreño, Andrés EstebanEl control de la calidad es fundamental en el área de microbiología debido a que permite identificar fallas, y de esta manera garantizar y cumplir con los requisitos de la calidad en cualquier proceso, mientras que, el antibiograma es una técnica que identifica sensibilidad o resistencia de una bacteria frente a uno o varios antibióticos. A pesar de que existen varias guías internacionales que aportan con información acerca de la lectura interpretativa del antibiograma como es el CLSI y el EUCAST no se ha planteado una armonización ni consenso de información entre ambas guías. Es por esto que el presente proyecto tiene la finalidad de ser una herramienta que ayude a promover la correcta lectura interpretativa del antibiograma tomando en cuenta el control de calidad dentro de los laboratorios de microbiología clínica de mediana y alta complejidad del Ecuador. Metodología: el proyecto de investigación se dividió en 3 componentes, en el primer componente se realizó la búsqueda bibliográfica siguiendo criterios de inclusión y exclusión, además de características específicas referentes al control de calidad dentro de la lectura interpretativa del antibiograma. En el segundo componente se estableció los contenidos que se abarcarían, seguido de esto se elaboró una guía para el control de calidad el cual comprende desde la identificación de una colonia bacteriana hasta la interpretación del antibiograma. Finalmente, el tercer componente engloba la esquematización completa de la información plasmada en el cual se utiliza diagramas de flujo y representación gráfica para una mayor comprensión del contenido presentado en el capítulo. Resultados: se redactó el capítulo de “Control de calidad en la lectura interpretativa del antibiograma” en el cual se detalló varios criterios de control de calidad con el fin de obtener información veraz y actualizada recopilada de las guías del CLSI y EUCAST, junto con otras fuentes bibliográficas. Además, se elaboraron diagramas e ilustraciones que facilitan y explican detalladamente la información contenida en el capítulo. Conclusiones: la guía basada en el control de calidad en la lectura interpretativa del antibiograma permitirá identificar errores con el fin de prevenirlos y garantizar la mejora de los procesos dentro del laboratorio de microbiología para minimizar el desarrollo de resistencia a los antibióticos. Del mismo modo, será un apoyo para estudiantes, personal de salud, profesores e investigadores ya que cuenta con información actualizada, veraz y completa.Item Open Access Diagnóstico oportuno de cromoblastomicosis y su relación con la disminución de complicaciones propias de la enfermedad(PUCE - Quito, 2022) Herrera Santana, Cristhian Rolando; Zabala Parreño, Andrés EstebanLa cromoblastomicosis es una infección fúngica crónica de la piel y tejido subcutáneo que es causada por inoculación traumática de un grupo específico de hongos dematáceos(Fonsecaea pedrosoi, Fonsecaea compacta, Phialophora verrucosa, Cladiphialophora carrionii y Rhinocladiella aquaspersa). Método: Se realizó una revisión bibliográfica narrativa se analizó estudios nacionales y a nivel mundial en los últimos veinte años. Resultados: Los patógenos causantes de CBM más frecuentes son Fonsecaea spp. Con 71.46% y Cladophialophora spp. 25.11%. seguidos de los patógenos menos frecuentes como lo son Rhinocladiella spp. con en 1.14%, Phialophora spp. con 1.36%, Bipolaris spp. y Exophiala spp. con 0.45% respectivamente. El agente etiológico más común en miembros inferiores es Fonsecaea pedrosoi con un 72.53%, seguido de Cladophialophora carrioni con un 25.78%. Por el contrario se evidencia que en miembros superiores el patógeno más comun es C.ladophialophora carrioni con el 46% seguido por F. pedrosoi, F. nubica y F. monophora con el 24%, 20% y 8% respectivamente. La zona corporal menos afectada por CBM es el tórax encontrando únicamente dos casos reportados en la investigación en donde los agentes causales son Phialophora verrucosa y Fonsecaea monophora. Conclusiones: el estudio realizado indica que 29 de los 467 casos estudiados no indican género ni especie del patógeno causante, esto se debe al polimorfismo de las lesiones por CBM, se lo puede confundir con mycetoma, esporotricosis, leishmaniasis, etcétera. Sin embargo, el género y especie del patógeno más prevalente en la investigación fue F. pedrosoi con el 67.02%.Item Open Access Diseño de un manual ilustrado físico y digital de micosis superficiales con importancia clínica, 2025(PUCE - Quito, 2025) Ortíz Pérez, Mayra Alejandra; Pérez Chica, Ingrid Odaliz; Zabala Parreño, Andrés EstebanLas micosis superficiales, infecciones fúngicas que afectan tejidos queratinizados como piel, cabello y uñas, constituyen un problema de salud pública mundial por su elevada prevalencia y carácter recurrente, situación que, sumada a la carencia de materiales didácticos en español sobre su diagnóstico y morfología, motivó la presente investigación cuyo objetivo fue diseñar un manual ilustrado físico y digital de micosis superficiales con importancia clínica orientado a estudiantes de laboratorio clínico, se realizó un estudio documental con enfoque cualitativo y diseño descriptivo con lineamientos PRISMA 2020, a través de una búsqueda sistemática en PubMed, Scopus y LILACS que arrojó 16 081 registros iniciales, de los cuales 251 fueron revisados en texto completo y 70 cumplieron los criterios de inclusión, lo que facilitó la construcción una matriz que integró información morfológica, fisiológica y diagnóstica de dermatofitos y levaduras del género Candida, así como las técnicas directas, de cultivo, bioquímicas y moleculares empleadas en su identificación, cuyos resultados sustentaron el desarrollo de un algoritmo diagnóstico escalonado y la estructuración de fichas estandarizadas por especie que sirvió de base para las ilustraciones originales y la herramienta digital vinculada mediante código QR, se concluyó que la sistematización de la evidencia ayudó a crear un recurso académico innovador, validado y accesible, que optimiza la enseñanza de la micología clínica, facilita la comprensión morfológica, mejora la precisión diagnóstica y promueve el aprendizaje, lo que constituye una contribución importante para la formación de futuros profesionales del laboratorio clínico en contextos hispanohablantes.Item Open Access Diseño de un sistema de capacitación continua de buenas prácticas de laboratorio para microbiología aplicada sobre una plataforma E-Learning(PUCE - Quito, 2015) Zabala Parreño, Andrés Esteban; Granda Moreno, Elena IsabelEl concepto de formación continua, es una modalidad educativa, dirigida a satisfacer las necesidades de actualización o perfeccionamiento de conocimientos, actitudes y prácticas que permiten lograr una mejor inserción y desempeño laboral de los profesionales, puede abarcar más que una forma de educación externa a las aulas, sino una serie de características adicionales donde la flexibilidad y la interactividad sean la esencia del proceso educativo.(Loza, 2000). El plan de capacitación plantea un proceso de desarrollo de recursos educacionales integrados en una plataforma educativa o entorno virtual de aprendizaje, que incorpora herramientas basadas en TIC y la educación a distancia como dispositivos para la formación continua y la capacitación de los analistas de laboratorio (Macau, 2004)(Elia Fernández-Díaz y Adelina Calvo Salvador, 2012). La plataforma que se va a utilizar es Dokeos E-learning Studio, está formando parte de los sistemas LMS (Learning Management Systems) que permite a instructores crear cursos en línea sobre diversos temas. Este sistema contiene todas las funcionalidades necesarias para el aprendizaje en línea y el aprendizaje combinado. La metodología que se propone en el proyecto reúne la documentación que es necesaria para realizar el desarrollo del diseño de la plataforma; donde se especifican que clases comprenderán la capacitación y los algoritmos que se usarán para resolver las funcionalidades que necesita la aplicación para su implementación. Dentro del diseño de la plataforma se identifica a tres usuarios: Alumno, Profesor y Administrador. Los resultados obtenidos al finalizar el diseño del sistema de capacitación continua de buenas prácticas de laboratorio para microbiología aplicada sobre una plataforma e-learning son los siguientes: - Para establecer un proceso de formación continua deben cumplir tres características básicas, e imprescindibles: interactividad, flexibilidad, y estandarización. - Para la elaboración del diseño de Buenas Prácticas de Laboratorio se utilizó materiales educativos multimedia, permitiendo integrar a la plataforma con el alumno, obteniendo como resultado un sistema donde el principal protagonista pasar a ser el alumno. - En la elaborar del sistema de capacitaciones por módulos, se puede presentar problemas por parte de algunos destinatarios que pueden presentar ciertas limitaciones del tipo tecnológico.Item Open Access “Diseño de una micoteca de importancia clínica a partir de cepas reactivadas en el laboratorio de micología clínica de la carrera de Bioquímica Clínica de la Pontificia Universidad Católica del Ecuador”(PUCE - Quito, 2017) Figueroa Carrasco, Alicia Isabel; Soria Aguirre, Daniela Alexandra; Zabala Parreño, Andrés EstebanLas micotecas a nivel mundial son consideradas centros para la conservación de hongos, las cuales permiten salvaguardar su integridad y así poder realizar nuevas investigaciones, generar nuevas técnicas para la enseñanza de la micología médica y así garantizar un adecuado diagnóstico fúngico encaminado a establecer un control y/o erradicación de la mayoría de los patógenos. Se efectúo un proyecto cuyo objetivo fue diseñar una micoteca de hongos de importancia clínica a partir de cepas ya colectadas y almacenadas en el laboratorio de Micología Clínica de la carrera de Bioquímica Clínica de la Pontificia Universidad Católica del Ecuador. Materiales y Métodos: De un total de 89 hongos se caracterizaron fenotípicamente 66 cepas disponibles en el laboratorio de Micología Clínica, los 23 hongos restantes solo fueron caracterizados microscópicamente debido a la falta de cepas. Para la caracterización fenotípica de los hongos se ejecutaron 6 técnicas de identificación con el fin de describir las características macroscópicas y microscópicas de cada hongo y como apoyo para todos los procesos se implementaron 4 procedimientos operativos estándar (POE´s) de ingreso de nuevas cepas, identificación de hongos filamentosos, identificación de hongos levaduriformes y por último el de codificación-almacenaje de los mismos, siendo cada uno de ellos apoyado con registros e instructivos. Resultados: Fueron aislados un total de 66 cepas, 61 hongos filamentosos los cuales fueron caracterizados fenotípicamente a través de la técnica de cinta adhesiva y microcultivo; además de ser almacenados por los métodos de agua destilada y papel filtro, también se aislaron 5 hongos levaduriformes que fueron identificados a través de las técnicas de Gram, API 20 C AUX, tubo germinal, técnica de clamidosporas y tinta china para Cryptococcus neoformans con su posterior almacenamiento a través de la técnica de repique en agar agar. Los 23 hongos restantes representan únicamente a los caracterizados microscópicamente debido a la falta de cepas para su aislamiento por lo tanto contamos únicamente con la técnica de identificación en placa. Cada uno de los hongos fue codificado con etiquetas de identificación según el tipo de hongo y el método de almacenamiento para ayudar a su rápido acceso, además de que cada proceso fue guiado con POE´s de cada uno de ellos. Conclusiones y Recomendaciones: A partir de la realización de la micoteca se obtuvieron productos como las placas generadas a partir de los microcultivos, los tubos obtenidos en el método de conservación de agua destilada al igual que los de papel filtro y repique en agar agar, cada uno de ellos codificado y almacenado en cajas porta placas, tuberas y cajas porta crioviales respectivamente. Finalmente para una mayor conservación de los hongos se recomienda usar métodos a largo plazo como la liofilización, además de la aplicación de técnicas moleculares para realizar una clasificación taxonómica de los mismos logrando mayor diversidad en la micoteca. También es importante seguir cada procedimiento operativo estándar para garantizar el mantenimiento de la micoteca.Item Open Access Factores de riesgo asociados a cáncer gástrico en pacientes atendidos en la Unidad Oncológica Peninsular – SOLCA, Santa Elena, en el período 2016 a 2018(PUCE - Quito, 2021) Calahorrano Ayala, Carla Massiel; Cortéz Gómez, Adriana Carolina; Zabala Parreño, Andrés EstebanLa presencia de una neoplasia maligna que surge de las células del estómago se conoce como cáncer gástrico. En el 2018 constituyó el 5.7% de los casos nuevos de todas las neoplasias en el mundo. En el Ecuador, entre el año 2016 y 2018 los fallecimientos por cáncer gástrico superaron los 4000 casos, lo que pone en evidencia el impacto de la enfermedad en la mortalidad de los ecuatorianos. Los principales factores de riesgo relacionados son: la infección por Helicobacter pylori, las dietas altas en sal, el uso de tabaco, entre otros y el índice de supervivencia disminuye en medida que el estadio del cáncer es más avanzado. Por esta razón, los métodos de detección precoz y medidas de prevención, como el estudio y manejo de los factores de riesgo, son formas efectivas para controlar la enfermedad y disminuir su mortalidad. Método: El estudio realizado fue de tipo observacional, descriptivo, retrospectivo. Se revisaron los 37 registros médicos de los pacientes con cáncer gástrico que fueron atendidos en SOLCA- Santa Elena durante el periodo 2016-2018, para la identificación de los factores de riesgo asociados al desarrollo de la enfermedad. Resultados: Se determinó que la neoplasia maligna del antro pilórico abarcó un 43.2% de la población, y al menos un 89.2% de los pacientes estuvieron en una etapa avanzada de la enfermedad. El 64.9% de pacientes presentaron tumores malignos pobremente diferenciados y el tipo de adenocarcinoma más frecuente fue el difuso con un 67.6%. Se encontró que la infección por H. pylori fue reportada en el 48.6% de la población y tuvo una relación estadísticamente significativa (P=0.033) con la neoplasia maligna del antro pilórico. Del mismo modo, existió una relación estadísticamente significativa (P=0.044) entre la infección por H. pylori y el carcinoma gástrico de tipo intestinal. Además, se evidenció una relación estadísticamente significativa (P=0.001) entre la senectud y el desarrollo de tumor maligno del antro pilórico. El mayor número de pacientes con cáncer gástrico fue de sexo masculino y el 100% cursaba una etapa avanzada de la enfermedad. Finalmente, los registros médicos no exhibieron información acerca de los procesos malsanos por lo que no fue posible realizar el análisis estadístico correspondiente. Conclusiones: El cáncer gástrico es un problema de salud para la provincia de Santa Elena y dentro de los factores de riesgo predominantes se encuentran la infección por H. pylori y lesiones premalignas, como la gastritis crónica. Otros factores, como el sexo y la edad, también influyen en el desarrollo de esta enfermedad y la gran mayoría de pacientes se encuentra en estadios avanzados dado su carácter insidioso. Por ello, es imperativo promover la prevención y tamizaje oportuno de cáncer gástrico en la provincia de Santa Elena.Item Open Access “Identificación de la bomba de eflujo tipo AdeABC como mecanismo de resistencia a la tigeciclina en aislados clínicos de Acinetobacter baumannii analizados en el INSPI-Quito durante el período 2015-2016”(PUCE - Quito, 2017) Albán Marañón, Viviana Atalía; Zabala Parreño, Andrés EstebanAcinetobacter baumannii es uno de los microorganismos patógenos más prevalentes causantes de Infecciones Asociadas a la Atención de la Salud (IAAS), cuya gravedad aumenta por sus altos índices de resistencia antimicrobiana, ocasionando una implícita reducción de opciones terapeúticas; en donde, la tigeciclina ha sido considerado un antibiótico de última línea para el tratamiento de este microorganismo especialmente en infecciones de piel y tejidos blandos. Los mecanismos de resistencia antimicrobiana más relevantes en Acinetobacter baumannii son de carácter enzimático, como la producción de oxacilinasas, y no enzimáticos como la disminución de la expresión de proteínas OMP; sin embargo, los sistemas de secreción, como la bomba de eflujo tipo AdeABC, son considerados mecanismos asociados a la resistencia antibiótica. Por lo tanto, el objetivo del presente estudio es identificar la actividad de la bomba de eflujo tipo AdeABC como mecanismo de resistencia a la tigeciclina y correlacionarlo con perfiles de susceptibilidad presentados en los aislados clínicos de Acinetobacter baumannii. Con respecto a la metodología utilizada, en este estudio se analizaron 85 cepas de Acinetobacter baumannii provenientes del Centro de Referencia Nacional de Resistencia Antimicrobiana RAM-Quito; los aislados fueron caracterizados a nivel de especie mediante identificación de secuencias especie-específicas del gen gyrB, y sus perfiles de susceptibilidad antimicrobiana se obtuvieron mediante difusión en disco y microdilución en caldo en el caso de la tigeciclina. La acción de la bomba de eflujo sobre la susceptibilidad a la tigeciclina fue evidenciada mediante el uso del inhibidor Carbonil Cianida 3-Clorofenilhidrazona (CCCP). A nivel molecular, se amplificaron los genes reguladores AdeS y AdeR y el gen estructural AdeB correspondientes a la bomba de eflujo tipo AdeABC mediante PCR de punto final. Como resultados, no se encontraron cepas resistentes a tigeciclina, sin embargo, nueve aislados fueron positivos para los genes AdeB, AdeS, AdeR y seis de ellos presentaron aumento de una a tres diluciones con respecto a la susceptibilidad a tigeciclina en presencia de CCCP. En conclusión, los resultados demuestran que la bomba de eflujo tipo AdeABC, está presente en varias cepas de Acinetobacter baumannii, aunque no se demostró su relación con la resistencia a tigeciclina. Sin embargo, este es un mecanismo importante que podría estar involucrado en la generación de cepas con perfiles multiresistentesItem Metadata only Identificación de la bomba de Eflujo tipo AdeABC como mecanismo de resistencia a Tigeciclina en Acinetobacter baumanniiNúñez de la Torre, Galo Enrique; Villacís Acuña, José Eduardo; Zabala Parreño, Andrés EstebanAcinetobacter baumannii es uno de los patógenos más importantes causantes de Infecciones Asociadas a la Atención de la Salud (IAAS). Está relacionado con pacientes inmunocomprometidos cuya estancia hospitalaria principalmente es la Unidad de Cuidados Intensivos (UCI). La resistencia antimicrobiana de esta bacteria es marcada y se encuentra mediada por la expresión intrínseca de enzimas tipo Oxacilinasas que bloquean la acción de cualquier antibiótico betaláctámico, entre estos los carbapenémicos. Es por esto que se ha considerado a la tigeciclina como terapia alternativa para el tratamiento de este tipo de infecciones; sin embargo, en la actualidad existen reportes de resistencia a este antibiótico relacionado con la presencia y sobreexpresión de bombas de eflujo, destacándose la de tipo AdeABC. El objetivo del presente estudio fue identificar la bomba de eflujo tipo AdeABC como un mecanismo de resistencia a tigeciclina y correlacionarlo con perfiles de susceptibilidad presentados.Item Open Access Lectura interpretativa del antibiograma de cocos Gram positivos basada en los criterios de organismos internacionales para la determinación de mecanismos de resistencia antimicrobiana a nivel de laboratorios de microbiología clínica de mediana y alta complejidad(PUCE - Quito, 2020) Cañadas Manosalvas, María Fernanda; García Jarrín, Paula Daniela; Zabala Parreño, Andrés EstebanLa elaboración de una herramienta para la lectura interpretativa del antibiograma es una necesidad imperativa en los laboratorios de mediana y alta complejidad del Ecuador. Esto se debe a que, según el del Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública – Dr. Leopoldo Izquieta Pérez (INSPI), existen 44 instituciones entre ellas hospitales privados, públicos y del Ministerio de Salud Pública (MSP) que son centinelas en la vigilancia de resistencias antimicrobianas (INSPI, 2018). Es importante que estas instituciones cuenten con una herramienta de apoyo que sea capaz de guiar la lectura interpretativa del antibiograma, especialmente en la técnica de Kirby Bauer, al ser esta una de las más empleadas en los laboratorios de microbiología para el estudio de susceptibilidad antimicrobiana (Syal et al., 2017). Debido a la importancia de la identificación, reporte y control de los mecanismos de resistencia, el contar con una guía para la lectura interpretativa del antibiograma en la que conste la disposición correcta y homologada de discos de antibióticos, facilitará la interpretación e identificación de fenotipos específicos como por ejemplo la resistencia inducible a lincosamidas en el caso de Staphylococcus spp. y Estreptococcus spp. (Comité de l’antibiogramme de la Société Française de Microbiologie, 2019). Además, dicha guía orientará interpretación de los resultados obtenidos facilitando la monitorización de mecanismos de resistencia comunes y emergentes actuando como una herramienta epidemiológica también (Coronell et al., 2018). Es importante mencionar que la interpretación del antibiograma trasciende la caracterización de las cepas según su respuesta al antibiótico seleccionado para el estudio de susceptibilidad, sino que también permite la inferencia del posible mecanismo de resistencia que posee la bacteria frente a una determinada familia de antibióticos (Courvalin, 1996). Además, se ha demostrado que la lectura interpretativa del antibiograma permite predecir la respuesta de un microorganismo frente antibióticos que no han sido testeados en las pruebas de susceptibilidad mediante el uso de discos marcadores como el uso de penicilina para enterococos según las reglas interpretativas de el Comité Europeo para Pruebas de Susceptibilidad Antimicrobiana (EUCAST) (Andreassan et al., 2015). Frente a la importancia y los beneficios de la lectura interpretativa del antibiograma se pone en la evidencia la necesidad de elaborar un documento capaz de hacer más accesible esta práctica a los laboratorios en el Ecuador ya que la interpretación del antibiograma ha sido y es realizada principalmente en países europeos (Cantón, 2010). Es así, como la elaboración de este documento se convertirá en una gran herramienta de apoyo para el personal de laboratorios de microbiología clínica en cuanto la interpretación de antibiogramas mediante la recopilación de los criterios dados por organismos internacionales.Item Open Access Lectura interpretativa del antibiograma en la familia Pasteurellaceae, de acuerdo con los discernimientos internacionales y nacionales en niveles de Laboratorios de Microbiología Clínica de mediana y alta complejidad en el Ecuador(PUCE - Quito, 2022) Calero Trávez, Daniela Carolina; Zabala Parreño, Andrés EstebanLa familia Pasteurellaceae son bacterias cocobacilares Gram negativas, contienen varias subdivisiones taxonómicas, entre los géneros que afectan al ser humano se hallan: Pasteurella, Actinobacillus, Haemophilus y Aggregatibacter. Estos microorganismos se caracterizan por ser de gran importancia, dado que sus resistencias antibióticas se evalúan de forma escasa. De esta manera, el presente proyecto tuvo como objetivo realizar un recurso bibliográfico ilustrativo, que establezca protocolos e información clínica sobre la correcta lectura del antibiograma en métodos como Kirby Bauer, ya que esta técnica es de gran demanda en laboratorios microbiológicos del país por su factibilidad económica y baja complejidad. Metodología: el estudio se basó en cuatro componentes; En el primero, se recopiló información sobre generalidades bacterianas y epidemiología. El segundo componente, se detalló la adecuada identificación microbiológica en procesos como difusión en disco, teniendo en cuenta su resistencia intrínseca y adquirida. Finalmente, de acuerdo con las sensibilidades y resistencias microbianas, el tercer componente incluyó recursos gráficos que indicaban la correcta posición de los antibióticos en los cultivos microbiológicos. Conclusiones: el capítulo permite ser una posible herramienta para un correcto manejo de la técnica Kirby Bauer en la familia Pasteurellaceae, puesto que se incorporan las aparentes resistencias que pueden afectar en el tratamiento de los pacientes. Asimismo, la información contribuye con el aprendizaje epidemiológico y las alternativas diagnósticas en torno a los controles de calidad recomendados.Item Metadata only Perspectives and recommendations for laparoscopic surgery in the COVID-19 era(2020) Zabala Parreño, Andrés Esteban; Zabala Parreño, Andrés EstebanA new human coronavirus called SARS-CoV-2 is currently causing a pandemic of the coronavirus disease 2019 (COVID-19). Healthcare institutions including surgical centers and their workers are in risk of contagion due to high exposure to SARS-CoV-2. The objective of the present manuscript is to review the available literature and elucidate the key points for maintaining safety in laparoscopic surgery during the pandemic. Currently, any patient who requires surgery and in whom the diagnosis of COVID-19 has not been ruled out should be treated as a positive patient and the correspondent safety measures should be taken. Surgical plume is a bioproduct that places healthcare workers who are exposed to it in a potential risk of acquiring different health conditions. There is no clear evidence to affirm that the exposure to surgical plume and pneumoperitoneum can cause COVID-19; nevertheless, as we do not know yet the real risk of transmission and infectivity of particles found in surgical smoke, it is recommended to take measures for a controlled evacuation of pneumoperitoneum and the use of a simple filtration system during laparoscopic surgery. We must understand that as our entire life changed with this pandemic, laparoscopic surgery should also change in particular aspects to give our patients the best treatment under the safest conditions as possible.Item Open Access Prevalencia de Aspergillus spp. en muestras de esputo inducido en pacientes con fibrosis quística en Ecuador(PUCE - Quito, 2019) Bustamante Cárdenas, Francis Mishel; Zabala Parreño, Andrés EstebanObjetivos: El objetivo de este estudio fue determinar la prevalencia de Aspergillus spp. a partir de muestras de esputo inducido provenientes de pacientes diagnosticados con fibrosis quística atendidos en el Hospital de Especialidades “Eugenio Espejo” y relacionar con el ensayo galactomanano en muestras de suero. Métodos: el presente estudio fue de tipo observacional y descriptivo, se analizaron 40 muestras de esputo inducido y suero de pacientes con fibrosis quística atendidos en el Hospital de Especialidades “Eugenio Espejo”. En las muestras de esputo inducido se identificó Aspergillus mediante cultivos en agares Sabouraud y Extracto de Malta. Las muestras de suero fueron analizadas mediante el KIT Platelia™ aspergillus EIA para la detección del antígeno galactomanano.Item Restricted 
Prevalencia de bacterias gram negativas en muestras de esputo inducido en pacientes con fibrosis quísticas en Quito(PUCE - Quito, 2019) Medina Jaramillo, Andrea Paola; Rodríguez Alvarado, Andrea Cristina; Zabala Parreño, Andrés EstebanObjetivo: establecer la prevalencia de bacterias Gram negativas en muestras de esputo inducido provenientes de pacientes diagnosticados de fibrosis quística; y la correlación el perfil de susceptibilidad detectado con la terapia antibiótica que han recibido en los últimos 6 meses. Métodos: se analizó un total de 40 muestras de esputo inducido de pacientes adultos diagnosticados con fibrosis quística del Hospital de Especialidades “Eugenio Espejo” de Quito. La caracterización fenotípica de las bacterias Gram negativas se realizó mediante pruebas bioquímicas. El perfil de susceptibilidad antibiótica fue analizado utilizando la técnica de difusión en disco, este perfil junto con el género y especie de cada bacteria Gram negativa fue confirmado con el sistema de identificación automatizado Vitek 2 compact con tarjetas ID GN /AST. Resultados: se aisló Pseudomonas aeruginosa en 22 pacientes con un incremento en resistencia levofloxacino de 39% a 64 % y ciprofloxacino de 28% a 45 % en los últimos 6 meses. Seguido de Haemophilus influenzae con un aumento del 25% en AMX. Conclusiones: Pseudomonas aeruginosa fue la bacteria más prevalente que presentó la mayor variabilidad en sus perfiles de resistencia entre ambos periodos de tiempo.Item Open Access Prevalencia de dermatofitos en los pacientes que acuden al Centro de Salud Urbirios del cantón Manta, provincia de Manabí en el año 2019(PUCE - Quito, 2020) Moya Blondet, Jorge David; Zabala Parreño, Andrés EstebanIntroducción: Las dermatofitosis es el conjunto de micosis superficiales producidas por hongos queratinofílicos del género Trichophyton, Micosporum y Epidermophyton que son capaces de parasitar la piel, pelo, uñas y sus anexos. De acuerdo a su origen se clasifican en antropofílicos, zoofílicos y geofílicos, lo que la hace una enfermedad transmisible, razón por la cual constituye una causa frecuente de consulta en atención primaria en zonas tropicales. Se caracteriza por el desarrollo de lesiones cutáneas con descamación, eritema, alopecia circular, prurito, cambios de color y forma de las uñas tanto en seres humanos como en animales. La gravedad de la infección depende de la virulencia del microrganismo, la susceptibilidad e hipersensibilidad del huésped, el estado inmunológico del paciente o enfermedades de base que lo compromete además de los factores predisponentes a los que se encuentran las personas para padecer esta enfermedad. Este estudio tuvo como propósito determinar la prevalencia de dermatofitos, el agente causal e identificar las causas o factores de riesgo relacionados a la aparición de estas infecciones micóticas. Materiales y métodos: El presente estudio fue de tipo observacional, descriptivo de corte transversal, se analizaron las muestras obtenidas de los pacientes con sospecha de lesión micótica superficial mediante la técnica directa con KOH para la visualización de estructuras fúngicas, para la identificación del agente micótico se utilizaron criterios morfológicos basados en las características macroscópicas y microscópicas de los cultivos analizados. Resultados: Se determinó una prevalencia de dermatofitos del 4.1%. El dermatofito aislado de mayor frecuencia fue del género Trichophyton 55.3%, seguido de Epidermophyton 2.1% en muestras de piel, cuero cabelludo y uñas; siendo los miembros superiores la zona más afectada, asociados principalmente al estilo de vida, calor y humedad de la zona geográfica donde se realizó el estudio. Además, se identificaron agentes levaduriformes 21.3% como especies de Candida y Malassezia; y hongos oportunistas 12.8%. Conclusiones y recomendaciones: Las infecciones por dermatofitos depende directamente de las condiciones ambientales de cada región como el calor y la humedad de las zonas vulnerables, tipo de población en estudio y los factores de riesgos predisponentes. El diagnóstico oportuno constituye una de las principales herramientas para un tratamiento adecuado y bien dirigido, evitando así fallas terapéuticas y aparición de cepas de hongos resistentes.