Browsing by Author "Quevedo Tumailli, Viviana Fernanda"

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    Comparación de dos métodos para analizar single-cell transcriptomics en plantas
    (PUCE - Quito, 2023) Quevedo Tumailli, Viviana Fernanda; Cervantes Pérez, Sergio Alan
    La secuenciación de ARN en el campo de la investigación genética, ha permitido comprender, entre muchas cosas, la función de los genes, la regulación génica, la expresión de los genes y los mecanismos de biología molecular. La expresión génica en plantas de la especie Arabidopsis thaliana permite estudiar los genes que se activan o desactivan para producir proteínas y otras moléculas que son esenciales para el crecimiento, desarrollo y respuesta a su entorno. Sin embargo, a pesar de contar con una gran cantidad de datos de expresión génica en bases de datos de libre acceso, la limitante común es la falta de profundidad en la comprensión de la expresión génica. El estudio de la expresión génica se ha realizado en las últimas décadas mediante microarreglos de ARN y luego mediante secuenciación de ARN para órganos o tejidos pero no con la resolución del nivel celular. La transcriptómica unicelular permite un análisis más detallado en comparación con la transcriptómica a gran escala, permitiendo analizar las diferencias en la expresión génica entre las células individuales. Uno de los métodos más utilizados para la transcriptómica unicelular es el Método de Protoplastos, que implica la degradación enzimática de la membrana celular, pero se ha visto limitada por la rigidez de la pared celular y el uso de tratamientos enzimáticos agresivos, como alternativa se encuentra el método llamado aislamiento de núcleos que permite separar y extraer los núcleos celulares directamente. En este sentido, se desconoce el impacto de los métodos utilizados en los resultados de transcriptómica unicelular en plantas. En este trabajo, la idea fue comparar la transcriptómica unicelular en condiciones similares de estos 2 métodos mencionados para evaluar las diferencias. Se usaron 5 muestras descargadas de la base de datos GSE155304 del NCBI, 2 muestras pr1 y pr2 para el Método Protoplastos y 3 muestras mr1, mr2 y mr3 para el aislamiento de núcleos con un promedio de células de 4316 y 3198 respectivamente.El presente trabajo ha permitido estudiar diferentes Métodos entre Protoplastos y aislamiento de núcleos para transcriptómica unicelular en plantas. Los conjuntos de datos procesados dan como resultado datos más refinados y de mayor calidad. En los dos métodos se observó una fuerte correlación entre el número de genes y el número de moléculas IMU, ya que los datos son consistentes y confiables. Se observó agrupaciones celulares similares en los métodos individuales, pero diferencias notables al integrar los datos de ambos métodos. El método UMAP se utilizó para reducir la dimensionalidad de los datos y el método de agrupación de Lovaina para identificar agrupaciones de interés. Ambos métodos mostraron resultados muy similares y confiables, por lo que la recomendación sería utilizar el método que más se adecue al tejido/planta de interés.
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    Incidencia de la utilización de software integrado, aplicando a la elaboración de material didáctico para los estudiantes con discapacidad auditiva del Centro de Educación Básica Intercultural de Sordos de Chimborazo
    (PUCE - Ambato, 2014) Quevedo Tumailli, Viviana Fernanda; Pailiacho Mena, Verónica Maribel
    En el presente trabajo se utilizó el software integrado en la elaboración del material didáctico para los estudiantes con discapacidad auditiva del Centro de Educación Básica Intercultural de Sordos de Chimborazo. Fue indispensable el uso del método inductivo partiendo del análisis de la situación actual de los métodos de enseñanza aplicados en el aula y en base a los temas del texto de primer año de acuerdo al nuevo currículo de la Educación General Básica se desarrollaron los contenidos didácticos digitales. Se aplicó las etapas del proceso para crear materiales educativos con nuevas tecnologías propuesto por Isabel Ogalde Careaga y Maricarmen González Videgaray. El software integrado se considera una herramienta que permite la integración de diferentes recursos y el desarrollo de distintas actividades interactivas las mismas que son evaluadas. La herramienta seleccionada se llama Constructor, una aplicación de código libre para el desarrollo del material didáctico. Después se realizó una encuesta a 21 docentes del Centro Educativo para determinar la incidencia del software en el proceso de enseñanza con los estudiantes con deficiencia auditiva, determinándose que el producto final tiene una interfaz amigable con elementos atractivos y es fácil de usar, está estructurado de tal forma que el estudiante revisa el contenido antes de realizar las actividades, obteniéndose los resultados logrados al finalizar cada tema, es aplicable en la Institución ya que está elaborado bajo los requerimientos establecidos ajustándose a las necesidades del docente y de los estudiantes.