Biodiversidad fúngica endófita y epífita de Citrus sinensis de dos localidades del Ecuador
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Citrus sinensis, naranja dulce, es cultivada y comercializada en Ecuador. La biodiversidad fúngica endófita y epífita de C. sinensis provenientes de Quevedo-Los Ríos y El Empalme-Guayas fue investigada. Noventa y seis muestras (hojas sanas, frutos sanos y frutos con lesiones superficiales) se procesaron, aislándose dieciocho hongos endófitos y diez epífitos. Secuencias provenientes de la región ITS de cada hongo fueron comparadas dentro de GenBank, NCBI. Se identificaron once especies dentro de un grupo de diecisiete géneros. Epicoccum nigrum fue la especie epífita y Colletotrichum gloeosporioides la endófita más aislada. La diversidad fúngica fue determinada utilizando índices ecológicos como: Riqueza de especies, Margalef, Shannon-Viewer, Simpson y Jaccard. Como resultado, Quevedo obtuvo una mayor riqueza de especies y un índice de Margalef mayor (4.27) sugiriendo que Quevedo posee alta heterogeneidad (H`=2.91) mientras que El Empalme una dominancia de especies (D=0.18) especialmente de Epicoccum nigrum. Tres especies fueron compartidas por las dos localidades Epicoccum nigrum, Leptosphaerulina chartarum y Epicoccum sp. (Ij=0.16). El análisis filogenético por el método Neighbor-Joining generó dendograma con un grupo Ascomycota y subdivisiones Pezizomycotina. En conclusión, frutos de Citrus sinensis de estas localidades ecuatorianas y época de muestreo presentaron una micobiota endófita y epífita diversa.