Estudio metagenómico del contenido intestinal de una ballena jorobada (megaptera novaeangliae) post mortem en la playa de Bahía de Caráquez, Manabí
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Date
2024-04
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Publisher
PUCE - Manabí
Abstract
El objetivo del presente estudio es conocer la composición microbiana del intestino de un ballenato de Megaptera novaeangliae encallado a través de un análisis metagenómico para así evaluar la funcionabilidad de esas bacterias y su relación con el organismo, esto ante la falta de información referente con respecto a la especie. La metodología implicó la recolección y almacenamiento de muestras de líquido intestinal tras el encallamiento del animal. Después, la extracción y secuenciación del ADN en laboratorios en Quito y Corea del Sur, respectivamente. La evaluación de la composición microbiana se realizó calculando diversos índices de diversidad para evaluar la muestra obtenida y analizar abundancia relativa y absoluta para establecer bacterias dominantes, así se construyeron árboles filogenéticos usando secuenciaciones de otras fuentes para establecer similitudes entre las comunidades bacterianas. El análisis de la diversidad bacteriana reveló una comunidad microbiana equilibrada y rica en especies, aunque ligeramente por debajo de la diversidad promedio esperada para los mamíferos marinos según lo indicado en las fuentes. Los principales filos bacterianos identificados fueron Bacteroidetes, Firmicutes, Proteobacteria y Fusobacteria, con una composición que difiere de estudios previos en otras ballenas, específicamente en la menor abundancia de Firmicutes, Se destaca la presencia de Pasteurella skyensis, bacteria posiblemente riesgosa para la salud de las ballenas, por lo que se debería prestar atención en el futuro a más casos de composición similares. Además, los análisis filogenéticos revelan una considerable diversidad genética entre las cepas consultadas, indicando adaptaciones específicas para cada especie y región.
Description
Keywords
Megaptera novaeangliae, Comunidad microbiana, Pasteurella skyensis