Identificación de genes de resistencia a antibióticos en bacterias presentes en vinaza de caña de azúcar (Saccharum officinarum) mediante análisis metagenómico

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dc.contributor.advisorSalguero Salas, Yadira Estefanía
dc.contributor.authorCulcay García, Mishelle Nathaly
dc.date.accessioned2026-01-15T17:38:25Z
dc.date.available2026-01-15T17:38:25Z
dc.date.issued2025
dc.description.abstractLa vinaza de caña de azúcar, subproducto del proceso para la obtención de etanol, es utilizada a gran escala como fertilizante debido a su alto contenido de nutrientes. No obstante, su aplicación recurrente en suelos agrícolas plantea ciertas implicaciones para el ambiente y la salud, entre ellas la posible diseminación de genes de resistencia a antibióticos (ARGs). Este trabajo realizó un análisis metagenómico in silico sobre 18 metagenomas de vinaza proveniente de una planta productora de alcohol ubicada en São Paulo, Brasil, con la finalidad de caracterizar la diversidad microbiana presente e identificar ARGs asociados. Se utilizaron herramientas bioinformáticas para analizar y procesar los datos, entre ellas Kraken2 y Bracken para la clasificación taxonómica, MEGAHIT para el ensamblaje de secuencias, MetaBAT2 para el agrupamiento de contigs en bins y ABRicate para la detección de ARGs, apoyada en las bases de datos ResFinder y CARD. El estudio reveló comunidades bacterianas dominadas por Firmicutes, con especies frecuentes como Megasphaera elsdenii y Lactobacillus amylovorus, las cuales han sido reportadas como portadoras de genes de resistencia antimicrobiana. Entre los genes identificados se encuentran lnu(A), lnu(B), lnu(C), erm(B), blaACI-1, lsaE y vat(E), asociados a resistencias frente a lincosamidas, macrólidos, betalactámicos y estreptograminas. Estos genes se detectaron con altos niveles de identidad y cobertura, lo que respalda su relevancia en la matriz analizada. Los resultados obtenidos indican que la vinaza representa un reservorio activo de ARGs en ambientes agrícolas, con implicaciones potenciales para la propagación de resistencia antimicrobiana.
dc.id.advisor1716426174
dc.id.author1500894694
dc.identifier.other15266
dc.identifier.urihttps://repositorio.puce.edu.ec/handle/123456789/47889
dc.language.isoes
dc.publisherPUCE - Quito
dc.subjectVinaza - Caña de azúcar
dc.subjectSaccharum officinarum
dc.subjectResistencia antibiótica
dc.subjectMetagenómica
dc.subjectFertilizantes orgánicos - Contaminación microbiana
dc.subjectFirmicutes - Genética
dc.titleIdentificación de genes de resistencia a antibióticos en bacterias presentes en vinaza de caña de azúcar (Saccharum officinarum) mediante análisis metagenómico
dc.typemasterThesis
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Tesis - Maestría en Biología Computacional