Ensamblaje del genoma mitocondrial de las especies andinas Drosophila cashapamba, Drosophila machachensis, Drosophila mesophragmatica, Drosophila guayllabambae y Drosophila papallacta (Diptera, Drosophilidae)
| dc.contributor.advisor | Vela Peralta, Doris Jimena | |
| dc.contributor.author | Vera Díaz, Carlos Leonardo | |
| dc.date.accessioned | 25/11/2023 8:50 | |
| dc.date.available | 25/11/2023 8:50 | |
| dc.date.issued | 2023 | |
| dc.description.abstract | El género Drosophila comprende muchas especies distribuidas a nivel global. Dentro de este género, se e encuentran las especies andinas del Ecuador D. cashapamba, D. guayllabambae, D. machachensis, D. papallacta y D. mesophragmatica de las cuales no se posee información molecular suficiente. Este estudio busca comparar los ensamblajes mitocondriales de estas especies al utilizar diferentes referencias, D. melanogaster y D. mojavensis. La razón de utilizar estas dos especies como referencias radica en el origen geográfico de ellas; D. melanogaster es una especie africana, mientras que D. mojavensis es una especie norteamericana. Para realizar los ensamblajes se utilizó la herramienta bioinformática de NOVOPlasty, las referencias serán procuradas del Centro Nacional para Información Biotecnológica, NCBI. Posterior al ensamblaje de las especies andinas ecuatorianas, se realizó el análisis comparativo mediante herramientas bioinformáticas. Se obtuvieron 10 ensamblajes en total, dos por cada especie, y 16 figuras dot plot, una comparando las referencias, 10 comparando el ensamblaje de las especies versus las referencias, y 5 comparando los ensamblajes de una misma especie. Estos resultados demostraron que ambas referencias arrojaban resultados similares, con unas pequeñas diferencias, siendo fragmentos de la región A+T de D. melanogaster. Hubo un caso extraordinario de D. papallacta cuando se utilizó a D. mojavensis como referencias, obteniendo un ensamblaje de 727 pares de bases, que no se relaciona a la diferencia entre los genomas mitocondriales de referencias. Se recomienda más análisis para determinar la razón de este caso. | |
| dc.id.advisor | 1712651197 | |
| dc.id.author | 0802903815 | |
| dc.identifier.uri | https://repositorio.puce.edu.ec/handle/123456789/20428 | |
| dc.language.iso | es | |
| dc.publisher | PUCE - Quito | |
| dc.subject | Bioinformática | |
| dc.subject | Fenómenos genéticos | |
| dc.subject | Genomas | |
| dc.subject | Insectos | |
| dc.subject | Drosophila | |
| dc.title | Ensamblaje del genoma mitocondrial de las especies andinas Drosophila cashapamba, Drosophila machachensis, Drosophila mesophragmatica, Drosophila guayllabambae y Drosophila papallacta (Diptera, Drosophilidae) |